Peroksidaz

Vasküler Peroksidaz 1
mevcut yapılar
PDB	Ortologları Bul: PDBe , RCSB enzim yapıları RCSB PDB , PDBe , PDBsum
tanımlayıcılar
Sembol	PXDN (HGNC: 14966)
; Harici tanımlayıcılar	EBI : PXDN; GeneCards : Gene PXDN; UniProt : PXDN; Enzim veritabanları IntEnz : IntEnz girişi ; BRENDA : BRENDA girişi ; ExPASy : NiceZime görünümü ; KEGG : KEEG girişi ; PRIAM : PRIAM profili ExplorEnz ; : ExplorEnz girişi MetaCyc ; : Metabolik yol
EC numarası	1.11.1.7
yer	Bölüm 2 s25.3
	Referanslar: AmiGO / QuickGO
ortologlar
İnsan	Fare
7837
Q92626	n/a
XM_056455	n/a
[5] ;
[6]
	v; sen; ve;

Laktoperoksidaz (Ön madde)
mevcut yapılar
PDB	Ortologları Bul: PDBe , RCSB enzim yapıları RCSB PDB , PDBe , PDBsum
tanımlayıcılar
Sembol	LPO (HGNC: 6678)
; Harici tanımlayıcılar	OMİM : 150205; EBI : LPO; GeneCards : Gene LPO; UniProt : LPO; Enzim veritabanları IntEnz : IntEnz girişi ; BRENDA : BRENDA girişi ; ExPASy : NiceZime görünümü ; KEGG : KEEG girişi ; PRIAM : PRIAM profili ExplorEnz ; : ExplorEnz girişi MetaCyc ; : Metabolik yol
EC numarası	1.11.1.7
yer	17 q23.1
	Referanslar: AmiGO / QuickGO
ortologlar
İnsan	Fare
4025
P22079	n/a
NM_006151	n/a
[3] ;
[4]
	v; sen; ve;

Eozinofil peroksidaz (Öncü)
mevcut yapılar
PDB	Ortologları Bul: PDBe , RCSB enzim yapıları RCSB PDB , PDBe , PDBsum
tanımlayıcılar
Sembol	EPX (HGNC: 3423)
; Harici tanımlayıcılar	OMİM : 131399; EBI : EPX; GeneCards : Gene EPX; UniProt : EPX; Enzim veritabanları IntEnz : IntEnz girişi ; BRENDA : BRENDA girişi ; ExPASy : NiceZime görünümü ; KEGG : KEEG girişi ; PRIAM : PRIAM profili ExplorEnz ; : ExplorEnz girişi MetaCyc ; : Metabolik yol
EC numarası	1.11.1.7
yer	17 q23.1
	Referanslar: AmiGO / QuickGO
ortologlar
İnsan	Fare
8288
P11678	n/a
NM_000502	n/a
[1] ;
[iki]
	v; sen; ve;

Vasküler Peroksidaz 2

mevcut yapılar

PDB

Ortologları Bul: PDBe , RCSB

enzim yapıları

RCSB PDB , PDBe , PDBsum

tanımlayıcılar

Sembol

PXDNL (HGNC: 26359)

Harici tanımlayıcılar

Enzim veritabanları

IntEnz : IntEnz girişi
BRENDA : BRENDA girişi
ExPASy : NiceZime görünümü
KEGG : KEEG girişi
PRIAM : PRIAM profili ExplorEnz
: ExplorEnz girişi MetaCyc
: Metabolik yol

EC numarası

1.11.1.7

yer

Bölüm 8 q11.21-q11.22

Gen ontolojisi


Referanslar: AmiGO / QuickGO

ortologlar

Türler

İnsan

Fare

n/a

RefSeq
(mRNA)

NM_144651

n/a

PubMed (Arama)

[7]

PMC (Arama)

[8]

Peroksidazlar , filogenetik yaşam ağacı boyunca yaygın olan bir enzim türüdür . Oksidoredüktazlar kategorisine aittirler ve Uluslararası Biyokimya ve Moleküler Biyoloji Birliği'nin Adlandırma Komitesine göre EC numaraları 1.11 ile sınıflandırılırlar .

Peroksidaz grubu

Oksidan olarak bir peroksit (adlarını borçlu oldukları) ve peroksit tarafından oksitlenen indirgeyici özelliklere sahip ikinci bir substrat kullanarak redoks bisubstrat reaksiyonlarını katalize ederler .

Sebzelerde , büyük stabilitesi, immünoglobulinlerle konjugasyon kolaylığı ve çok sayıda reaktif kullanılarak kolorimetrik yöntemlerle saptanmasının basitliği nedeniyle immünokimyasal tekniklerde ve klinik tanıda büyük uygulamalara sahip olan yaban turpu peroksidazı (HRP) vurgulanmalıdır . Hayvanlarda , tükürük , süt veya lökositlerde ağırlıklı olarak savunma işlevi olan peroksidazlar vardır; burada, endojen olarak diğer reaksiyonlar (glikoz oksidaz, amino asit oksidaz, vb.) tarafından üretilen peroksidin oksitleyici özelliği, mikrop öldürücü ve bakteri öldürücü amaçlar için kullanılır. . Tüm peroksidazlar savunma amaçlı değildir ve örneğin bir peroksidaz ( iyodür peroksidaz ) tiroid hormonlarının sentezinden de sorumludur , bu durumda iyodidi iyodine oksitleyerek tiroglobulinden tirozin kalıntılarının bazı fenolik halkalarına eklenir . Glutatyon peroksidaz gibi diğer peroksidazlar, farklı amaçlar için çeşitli dokularda yaygın olarak dağılır, ancak bir antioksidan işlevi ile ilişkilidir.

_{Hemen hemen tüm peroksidazlar hemoproteinlerdir (} belirgin bir istisna, bir selenoprotein olan glutatyon peroksidazdır ) ve ortak substratları olarak _H2O2 veya hidrojen peroksit içerir . Bu substrat için büyük afinite, aktif merkezin iki düzlemi (üst ve alt) yoluyla hem grubunun demirine bağlanabileceği anlamına gelir, bu da substrat fazlalığından dolayı bir inhibisyona yol açar, çünkü her iki pozisyon da olduğunda hem peroksit tarafından işgal edilen diğer substrata hidrojen bağlanması mümkün değildir.

Bu diğer substrat ile ilgili olarak , bu enzimatik aktiviteyi saptamak için "in vivo" oksitlenenlere veya "in vitro" kullanılanlara atıfta bulunalım, doğası ve kimyasal yapısı çok farklı olabilir. Bunlara fenoller , aromatik aminler , ABTS gibi kompleks organik moleküller (kuru şeritlerde kan parametrelerinin belirlenmesi için Reflotrón uygulamasına bakınız) veya yukarıda bahsedilen iyodür ve glutatyon dahildir. İndirgeyici substrat için bu zayıf özgüllük, afinitenin de düşük olmasına neden olur.

Peroksidaz enzimi

Peroxidase , EC 1.11.1.7 2008-09-16'da Wayback Machine'de arşivlendi , hidrojen peroksitin oksitleyici gücünü kullanarak çok sayıda organik ve inorganik substratın oksidasyonunu katalize eden bir enzimdir.

Donör + H ₂ O ₂ Oksitlenmiş Donör + H ₂ O $\sağsol zıpkınlar$

Bu enzim hem grubunu kofaktör olarak kullanır .

Klinik biyokimyada yaygın olarak kullanılmaktadır . Bu nedenle, biyolojik sıvılardaki glikoz , ürik asit , kolesterol veya trigliseritler gibi metabolitlerin belirlenmesi ve nicelendirilmesine yönelik tahliller, birleştirilmiş bir enzim olarak peroksidaz kullanır. Ayrıca, AIDS'e veya herpes virüsüne neden olan insan immün yetmezlik virüsü ( HIV ) gibi iyi bilinen virüslerin saptanması için immünolojik testlerde de kullanılır . Peroksidaz ayrıca fenolik reçineler, yapıştırıcılar , antioksidanlar , antistatik ve manyetik radyasyon koruyucular, gıda boyaları ve deterjanların biyoaktif bileşenleri gibi biyoteknolojik ve endüstriyel açıdan ilgi çekici ürünlerin üretimi için bir biyokatalizör olarak da kullanılır .

İnsan peroksidaz genleri , bir hafif zincir ve bir uzun zincir ifade eder. Aktif enzimler, 2 hafif zincir ve 2 ağır zincirden oluşan bir heterotetramerdir. Kofaktörler olarak, bir hafif zincir ve bir uzun zincir tarafından oluşturulan her bir heterodimer için bir kalsiyum iyonuna ve hidroksillenmiş metil gruplarına ester bağları yoluyla kovalent olarak bağlı bir hem grubu B'ye (demir-protoporfirin IX) ihtiyaç duyarlar. Bu bağlar, heme'nin C-1 ve C-5 pozisyonlarında hidrojen peroksit ile otokatalitik olarak oluşur.

İnsanlar ayrıca miyeloperoksidaz sentezler . Bu enzim, bakterisidal fonksiyonlarla bağışıklık sisteminde kullanılır.

Çok yönlü peroksidaz enzimi

The Versatile Peroxidase (VP) Enzyme EC 1.11.1.16 2008-10-11'de Wayback Machine'de arşivlendi . reaksiyonu katalize eder :

Donör + H ₂ O ₂ Oksitlenmiş Donör + H ₂ O $\sağsol zıpkınlar$

Ligninolitik mantar Pleurotus eryngii tarafından üretilir ve diğer iki lignolitik peroksidaz enzimi, manganez peroksidaz ve lignin peroksidaz ile aynı özgüllüğe sahiptir . Bu enzim için kofaktör olarak 1 hem grubu B (demir-protoporfirin IX) ve alt birim başına 2 kalsiyum iyonu gereklidir.

Bu proteinin üç türü vardır:

Çok Yönlü Sıvı Fazlı Peroksidaz 1 (VPL1) . Q9UR19 .
Çok yönlü sıvı faz peroksidaz 2 (VPL2) . O94753 .
Katı faz çok yönlü peroksidaz 1 (VPS1) . Q9UVP6 .

Peroksidaz renk giderici boya

Enzim boya ağartma peroksidaz (DyP) EC 1.11.1.19 13 Eylül 2019, Wayback Machine sitesinde arşivlendi . reaksiyonu katalize eder:

Mavi Reaktif 5 + H ₂ O ₂ + 2 H ⁺ Oksitlenmiş Mavi Reaktif 5 + 2 H ₂ O $\sağsol zıpkınlar$

D&P, Basidiomycota mantarları ve öbakteriler tarafından salgılanan proksimal histidin proteinleridir . Çok yönlü peroksidaza çok benzerler, ancak antrakinon boyalarını verimli bir şekilde oksitleme yetenekleri ve Mn2 ⁺ iyonunu oksitleyememeleri bakımından ondan farklıdırlar . Reaktif mavi 5, oksidatif ve hidrolitik adımları birleştiren ve ftalik asit oluşumuyla biten benzersiz bir mekanizma aracılığıyla yüksek verimlilikle dönüştürülür . Thermobifida fusca bakterisinden elde edilen enzim ayrıca sülfoksidasyon reaksiyonlarını katalize eder.

Uygulamalar

Peroksidaz, kirli suyun endüstriyel arıtılması için kullanılır: örneğin, fenoller Armoracia rusticana'dan peroksidaz katalizli polimerizasyonları ile uzaklaştırılabilir .

Sinovyumdaki ( at eklemlerindeki ) ortalama miyeloperoksidaz enzim aktivitesi , septik artritin varlığı ile ilgilidir , bu nedenle bir belirteç olarak kullanılabilir. ^[¹ ]

Araştırmada, Western blot veya ELISA gibi tekniklerde antikorların etiketlenmesi için yaygın olarak kullanılmaktadır . Bu şekilde, enzimin (antikorun ve nihayetinde antijenin) varlığı, katalize ettiği kimyasal reaksiyon saptanarak saptanır .

Referanslar

↑ Moschos, A. (2007) Attaki eklem sıvısının analizi - özellikle hastalıklı eklemlerden ve tendon kılıflarından sinovyadaki miyeloperoksidaz enziminin deaktivitesi Doktora Tezi, FU-Berlin Almanya

Dış bağlantılar

ExPASy'de Peroksidaz 2008-09-16'da Wayback Machine'de arşivlendi . (İngilizcede).
ExPASy'de çok yönlü peroksidaz 2008-10-11'de Wayback Machine'de arşivlendi . (İngilizcede).
Dye Decolorizing Peroxidase, ExPASy'de 13 Eylül 2019, Wayback Machine sitesinde arşivlendi . (İngilizcede).

[1] Moschos, A. (2007) Attaki eklem sıvısının analizi - özellikle hastalıklı eklemlerden ve tendon kılıflarından sinovyadaki miyeloperoksidaz enziminin deaktivitesi Doktora Tezi, FU-Berlin Almanya

[