Wiązka helisy - Helix bundle
Spirala wiązkę jest mały białko krotnie składa się z kilku helis alfa , które są zwykle prawie równoległe lub przeciwrównoległe względem siebie.
Wiązki trzech helis
Wiązki trzech helis są jednymi z najmniejszych i najszybszych znanych wspólnie fałdujących się domen strukturalnych. Wiązka trzech helis w domenie nagłówka villina ma tylko 36 aminokwasów długości i jest częstym przedmiotem badań w symulacjach dynamiki molekularnej, ponieważ jej czas fałdowania w skali mikrosekundowej mieści się w skalach czasowych dostępnych dla symulacji. 40- resztowe białko pomocnicze HIV ma bardzo podobny fałd i było również przedmiotem szeroko zakrojonych badań. Nie ma ogólnego motywu sekwencji związanego z wiązkami trzech helis, więc niekoniecznie można je przewidzieć na podstawie samej sekwencji. Wiązki trzech helis często występują w białkach wiążących aktynę i białkach wiążących DNA .
Wiązki czterohelisowe
Wiązki czterohelisowe zazwyczaj składają się z czterech helis upakowanych w układzie zwojów ze sterycznie ciasno upakowanym hydrofobowym rdzeniem w środku. Pary sąsiednich helis są często dodatkowo stabilizowane przez mostki solne pomiędzy naładowanymi aminokwasami. Osie helisy są zazwyczaj zorientowane około 20 stopni od sąsiednich helis, co jest znacznie płytszym nachyleniem niż w większej spiralnej strukturze fałdy globinowej .
Specyficzna topologia helis jest zależna od białka – helisy sąsiadujące w sekwencji są często antyrównoległe , chociaż możliwe jest również ustawienie antyrównoległych połączeń między dwiema parami równoległych helis. Ponieważ dimeryczne zwoje typu coiled-coil są same w sobie stosunkowo stabilne, wiązki czterohelisowe mogą być dimerami par typu coiled-coil, tak jak w białku Rop . Wiązka czterohelisowa może mieć stabilność termiczną większą niż 100 °C. Inne przykłady wiązek czterohelisowych obejmują cytochrom , ferrytynę , ludzki hormon wzrostu , cytokinę i C-końcowy represor Lac . Fałdowanie wiązki czterohelisowej okazało się atrakcyjnym celem dla projektowania białek de novo , przy czym liczne białka wiązki czterohelisowej de novo pomyślnie zaprojektowano metodami racjonalnymi i kombinatorycznymi. Chociaż sekwencja nie jest zachowana wśród wiązek czterech helis, wzorce sekwencji mają tendencję do odzwierciedlania tych ze struktur spiralnie zwiniętych, w których co czwarta i siódma reszta jest hydrofobowa.
