Fascio dell'elica - Helix bundle
Un fascio di eliche è una piccola piega proteica composta da diverse alfa eliche che di solito sono quasi parallele o antiparallele l'una all'altra.
Fasci a tre eliche
I fasci a tre eliche sono tra i domini strutturali a ripiegamento cooperativo più piccoli e conosciuti. Il fascio a tre eliche nel dominio della testa della villina è lungo solo 36 amminoacidi ed è un argomento di studio comune nelle simulazioni di dinamica molecolare perché il suo tempo di ripiegamento su scala di microsecondi rientra nei tempi accessibili alla simulazione. La proteina accessoria dell'HIV a 40 residui ha una piega molto simile ed è stata anche oggetto di studi approfonditi. Non esiste un motivo di sequenza generale associato ai fasci a tre eliche, quindi non possono essere necessariamente previsti dalla sola sequenza. I fasci a tre eliche si verificano spesso nelle proteine leganti l'actina e nelle proteine leganti il DNA .
Fasci a quattro eliche Four
I fasci a quattro eliche sono tipicamente costituiti da quattro eliche impacchettate in una disposizione a spirale con un nucleo idrofobo stericamente chiuso al centro. Le coppie di eliche adiacenti sono spesso ulteriormente stabilizzate da ponti salini tra amminoacidi carichi. Gli assi dell'elica sono tipicamente orientati a circa 20 gradi dalle loro eliche vicine, un'inclinazione molto meno profonda rispetto alla struttura elicoidale più grande della piega globinica .
La topologia specifica delle eliche dipende dalla proteina: le eliche adiacenti in sequenza sono spesso antiparallele , sebbene sia anche possibile disporre collegamenti antiparalleli tra due coppie di eliche parallele. Poiché le bobine a spirale dimeriche sono esse stesse relativamente stabili, i fasci a quattro eliche possono essere dimeri di coppie di bobine a spirale, come nella proteina Rop . Il fascio a quattro eliche può avere una stabilità termica superiore a 100 °C. Altri esempi di fasci a quattro eliche includono citocromo , ferritina , ormone della crescita umano , citochina e repressore Lac C-terminale. La piegatura del fascio a quattro eliche si è dimostrata un bersaglio attraente per la progettazione di proteine de novo , con numerose proteine del fascio a quattro eliche de novo che sono state progettate con successo con metodi razionali e combinatori. Sebbene la sequenza non sia conservata tra i fasci a quattro eliche, i modelli di sequenza tendono a rispecchiare quelli delle strutture a spirale in cui ogni quarto e settimo residuo è idrofobo.
