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Chlamydia

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Chlamydia
Frottis de Pap montrant la chlamydia dans les vacuoles 500x H&E.jpg
PAP microscopique montrant Chlamydia dans des vacuoles. 500x
taxonomie
Domaine : Bactérie
Filo : Chlamydiota
classe : Chlamydia
Commande : Chlamydiales
famille : Chlamydiaceae
Râteau, 1957
sexe : ChlamydiaJones
et al. , 1945
espèce type
Chlamydia trachomatis
Espèces
Voir le texte (section taxonomie) pour plus d'informations
Synonymie
  • Chlamydophila ( C. abortus , C. caviae , C. felis , C. pecorum , C. pneumoniae et C. psittaci uniquement)

Chlamydia (du grec χλαμύς / χλαμυδως, khlamýs / khlamýdös : "manteau" ou "cagoulé") est un genre de bactéries gram - négatives de la famille des Chlamydiaceae , ordre des Chlamydiales , phylum Chlamydiota . Chlamydia, considérée comme la maladie bactériologique la plus courante [ 1 ] qui se transmet par le sexe vaginal, anal, oral et par contact avec des liquides dans des lieux de mauvaise hygiène. [ 2 ] Il se guérit avec un antibiotique et la meilleure prévention est un préservatif.

Castellanisé comme chlamydia , et génériquement compris comme pluriel (les chlamydiae) pour désigner Chlamydia spp. , la taxonomie et la nomenclature de ce groupe est une question controversée sur laquelle il n'y a pas d'accord complet entre les experts (voir la section Taxonomie ci- dessous), ni la forme de contagion. Avec les informations actuellement disponibles, taxonomiquement et systématiquement , le genre Chlamydia comprend trois espèces : C. trachomatis , C. muridarum et C. suis . [ 3 ]

Cliniquement, quatre espèces pathogènes majeures sont actuellement reconnues pour l'homme : C. trachomatis , C. pneumoniae , C. psittaci et C. pecorum . Les deux premiers sont considérés comme des parasites stricts de l'être humain et de la transmission interhumaine (producteurs de maladies infectieuses et contagieuses ). En revanche, C. psittaci et C. pecorum sont des agents pathogènes secondaires des oiseaux et des mammifères.

Microbiologie

La chlamydia est un groupe de petites bactéries (initialement considérées comme des virus), ce sont des bacilles gram-like, leur caractéristique principale est le cycle réplicatif intracellulaire, ce qui en fait des parasites obligatoires.

Ils ont une paroi cellulaire bactérienne, cependant, le peptidoglycane est absent ou presque imperceptible (bien qu'il ait des gènes pour sa synthèse). Les principaux antigènes chlamydiens sont présents dans la paroi (dans la « membrane externe »), qui contient le lipopolysaccharide (LPS), la protéine majeure de la membrane externe (MOMP) et deux autres protéines riches en cystéine : une protéine d'enveloppe (62 Kd) et une lipoprotéine. (12Kd).

MOMP et LPS sont les composants antigéniques les plus importants.

Ces bactéries expriment un épitope lipopolysaccharidique famille-spécifique (ancien épitope genre-spécifique). Teneur en G+C d'environ 40 % en moles.

Mode de vie

Ce sont des parasites intracellulaires obligatoires des cellules de vertébrés . Possédant cette caractéristique, ils échappent souvent au système immunitaire . Son cycle de développement prend deux formes : le corpuscule élémentaire et le corpuscule réticulé ou initial, qui représentent respectivement la forme extracellulaire et intracellulaire du parasite.

Culture : ils ne sont pas cultivés dans les milieux microbiologiques habituels, en ayant recours à des cultures cellulaires.

Les chlamydiae sont des bactéries intracellulaires , car elles ne possèdent pas toute la machinerie nécessaire à leur croissance. Cette croissance intracellulaire permet à Chlamydiae de produire une infection chronique en empêchant la reproduction de la cellule qu'elle infecte. Ce mécanisme d'infection chronique explique la pathogenèse de certaines maladies qu'elles produisent : artériosclérose dans le cas de Chlamydia pneumoniae , trachome avec cécité , et salpingite avec obstruction tubaire dans le cas de Chlamydia trachomatis . De plus, les Chlamydiae peuvent avoir des périodes de latence, accumulant une charge bactérienne dans le réticulum des organes sexuels mâles et femelles, attendant un stimulus qui permet la reproduction bactérienne.

Taxonomie

Chlamydia est un taxon générique inventé en 1945 par Jones et al. , présentant Chlamydia trachomatis comme l'espèce type du taxon. [ 4 ]

Classiquement, c'est-à-dire de 1971 à 1999, quatre espèces étaient acceptées au sein du genre Chlamydia (selon la classification de Stolz et Page) : [ 5 ]

  1. Chlamydia trachomatis (Busacca 1935) Rake, 1957, souche type : ATCC VR-571.
  2. Chlamydia pneumoniae ;
  3. Chlamydia pecorum ;
  4. Chlamydia psittaci (Lillie 1930) Page, 1968, souche type : ATCC VR-125.

C. psittaci se distinguait de C. trachomatis par sa résistance à la sulfadiazine , bien que tous les C. psittaci n'étaient pas résistants ; C. pneumoniae a été classé en fonction de son apparence au microscope électronique (EM) et de sa capacité à infecter les humains, bien que l'apparence EM trouvée diffère d'une étude à l'autre, et toutes ces spp. ils ont infecté les humains.

Genre Chlamydophila

Chlamydophila était un genre qui regroupait certaines espèces appartenant à Chlamydia . Il est actuellement considéré comme un synonyme . [ 6 ] En avril 1999, suite à la soumission et à la proposition d'Everett, Bush et Andersen d'une nouvelle classification des Chlamydiaceae, cinq nouvelles espèces ont été validées, tandis que C. pneumoniae , C. pecorum et C. psittaci ont été déplacés vers un nouveau genre : Chlamydophile . La nouvelle classification a été présentée comme suit : [ 7 ]

  • La famille des Chlamydiaceae, classiquement présentée avec plusieurs genres ( Chlamydia ), serait désormais divisée en deux genres : Chlamydia et Chlamydophila gen. nov.
  • Chlamydophila diffère de Chlamydia par son séquençage génétique et lipidique, produit du glycogène détectable et n'a qu'un seul opéron ribosomal, alors que Chlamydia en a trois.
  • Deux nouvelles espèces : Chlamydia muridarum sp. nov. et Chlamydia suis sp. nov. , rejoignez le Chlamydia trachomatis primitif dans le genre désormais modifié Chlamydia .
  • Chlamydia spp. il ne s'agirait que de : C. trachomatis (humains), C. suis (porcs) et C. muridarum (souris et hamsters).
  • Gène chlamydophile. nov. s'assimile aux espèces actuelles Chlamydia pecorum , Chlamydia pneumoniae et Chlamydia psittaci , pour devenir Chlamydophila pecorum comb. nov. , peigne Chlamydophila pneumoniae. nov. et le peigne Chlamydophila psittaci. nov.
  • Trois nouvelles espèces de Chlamydophila sont dérivées de Chlamydia psittaci : Chlamydophila abortus gen. nov., sp. nov. , Gène de Chlamydophila caviae. nov., sp. nov. et le gène de Chlamydophila felis. nov., sp. nov.

La taxonomie établie pour Chlamydiae en 1999 utilise les critères dominants pour classer les bactéries, y compris la réassociation ADN-ADN , l'ARN ribosomique 16S et 23S , la similarité des gènes, des séquences de gènes codant pour des protéines similaires et la taille du génome . Des critères tels que la « détection d' antigène » , le glycogène , l'association à l'hôte et la morphologie EM sont utilisés, en fonction de l'applicabilité et de la disponibilité. En 1999, de nombreuses races de Chlamydia ont été réorganisées dans le genre Chlamydophila .

La similarité moyenne de réassociation ADN- ADN distinguant Chlamydophila de Chlamydia est de 10,1 % ( intervalle de confiance à 95 % : 6,8-13,5), une valeur permettant de séparer les genres. [ citation nécessaire ]

La divergence de Chlamydophila avec Chlamydia est indiquée par un codage de protéine de séquence similaire et des gènes d'ARN ribosomal. Les séquences des gènes des ARN ribosomiques Chlamydophila et Chlamydia 16S les rapprochent de plus de 95 %. Cependant, 95% n'est pas le seuil pour séparer les genres de Chlamydiaceae, mais c'est une ligne directrice pour établir de nouveaux genres dans la famille des Chlamydiales.

L' ARN ribosomal 23S des espèces Chlamydophila et Chlamydia avait moins de 95 % de similarité. [ citation nécessaire ]

Certains critères moléculaires distinguant Gro. Chlamydiacées
Le genre Site Génomes Glycogène détectable Nombre de travail avec les Operènes
Chlamydophile 1,2 (environ) Non 1
Chlamydia 1,0 (environ) Et c'est deux

En août 2000, une reclassification des Chlamydiae a été présentée par Karin Everett lors de la quatrième réunion de la Société européenne pour la recherche sur les Chlamydia à Helsinki , en Finlande. Cette classification de Chlamydia est basée sur des critères phénotypiques, morphologiques et génétiques limités (car, par exemple, elle ne prend pas en compte les analyses récentes de l'opéron ribosomal ou d'autres organismes intracellulaires obligatoires qui ont un cycle réplicatif similaire à celui des chlamydiae). [ 8 ]

Un grand nombre d'éminents chlamydologues, pour la plupart non taxonomistes, se sont opposés à la nouvelle classification. Leurs objections ont été publiées dans une lettre (Schachter et al. , 2001) adressée à l' International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . La lettre a ensuite été répondue par les auteurs de la nouvelle classification (Everett & Andersen, 2001).

Alors que la présence des 9 espèces au sein de la famille des Chlamydiaceae n'était pas particulièrement controversée, les principales critiques de la nouvelle taxonomie étaient :

  1. Il n'y a pas assez de raison de diviser les Chlamydiaceae primitives en deux nouveaux genres, et c'est contre-productif.
  2. Il a fallu beaucoup de temps aux cliniciens pour s'habituer à la chlamydia et ce serait déroutant pour eux.
  3. Trop d'importance a été accordée aux séquences nucléotidiques courtes et peu ou pas suffisamment d'attention a été accordée aux caractéristiques biologiques de base.
  4. Les preuves pour certaines espèces et familles, principalement les Waddliaceae et les Simkaniaceae, reposent sur des données limitées et isolées.
  5. Certains se sont opposés au nom générique Chlamydophila (choisi par les autorités de la nomenclature) dont la signification est « simil-Chlamydia ».

D'autres auteurs, comme Michael Ward, considèrent que « la nouvelle classification d'Everett et al. il a été correctement examiné et approuvé par les autorités taxonomiques internationales et devrait prévaloir jusqu'à ce qu'il soit dépassé par de nouvelles connaissances et un système plus efficace. C'est parce qu'il intègre la recherche moléculaire récente et les connaissances actuelles sur l'évolution microbienne." [ 9 ]

En 2015, un article de Sachse et al. a envisagé de fusionner à nouveau les genres Chlamydia et Chlamydophila parce que les différences entre les espèces ne sont pas assez importantes pour séparer les deux genres. L'analyse de la séquence génétique de l' ARN ribosomal 16S qui a favorisé la séparation en deux genres faite par Everett, mentionnée ci-dessus, a montré que la similarité entre eux était supérieure à 94,5 % —le point de coupure qui est habituellement considéré pour distinguer les genres— parmi presque toutes les espèces de Chlamydia. De plus, le séquençage et la comparaison de génomes complets montrent que le pourcentage de protéines conservées est de 82 %, bien supérieur au seuil habituellement considéré, 50 %. Comme dernière raison, il a été soutenu que les espèces ont des caractéristiques phénotypiques similaires . [ 10 ] Même avant la publication de cet article, le Bergey's Manual of Systematic Bacteriology considérait déjà Chlamydia dans son édition la plus récente à cette date comme un seul genre qui incluait Chlamydophila [ 10 ] et continue de le faire dans son édition la plus récente 2015 [ 11 ] _

Chlamydia spp .

Il existe trois espèces du genre Chlamydia qui affectent les humains :

L'infection génitale peut être asymptomatique chez les femmes, mais causer des dommages à leur appareil génital avec des complications futures de leur fertilité en provoquant une inflammation du cou appelée cervicite, ou maladie inflammatoire pelvienne ou PID qui est la cause des avortements et de la stérilité. De plus, la femme peut l'infecter sans même savoir qu'elle était malade.

  • Chlamydia pneumoniae : 90 % présentent une infection subclinique. Être capable de produire une pharyngite, une otite moyenne, une pneumonie atypique. On pense qu'il contribue à la formation de plaques d'athérosclérose.

La chlamydia est une infection bactérienne. Chaque année, il y a environ 3 millions de nouveaux cas chez les hommes et les femmes, ce qui en fait l'une des infections sexuellement transmissibles les plus courantes.

Si une femme enceinte attrape la chlamydia et n'est pas traitée, elle peut avoir un bébé prématuré. Si un bébé est infecté pendant l'accouchement, il peut développer des infections oculaires (conjonctivite) ou des problèmes respiratoires.

La chlamydia est connue comme la maladie "silencieuse" car 3 femmes infectées sur 4 ne présentent aucun symptôme. [ 12 ] Certaines femmes ressentent une modification des pertes vaginales ou des mictions douloureuses.

Les professionnels de la santé utilisent un test de laboratoire pour diagnostiquer la chlamydia chez les femmes. Certains tests utilisent un échantillon d'urine. D'autres tests utilisent un échantillon de cellules du col de l'utérus de la femme. La chlamydia peut être traitée avec des antibiotiques.

Il est recommandé aux femmes enceintes de demander à leur médecin de tester la chlamydia au début de leur grossesse. En cas d'infection, des antibiotiques peuvent être pris pour traiter l'infection et les complications pour la mère et le fœtus seront évitées.

Le partenaire d'une femme enceinte doit également être traité car ils peuvent se transmettre l'infection. Les infections à chlamydia peuvent être évitées pendant la grossesse en n'ayant pas de relations sexuelles. Les personnes qui ont des relations sexuelles :

  • Ils devraient avoir des relations sexuelles avec une seule personne qui n'a pas d'autres partenaires sexuels, qui a été testée pour la chlamydia et qui n'est pas infectée.
  • Ils doivent utiliser un préservatif en latex ou un préservatif.
  • Si votre médecin vous prescrit des antibiotiques, vous devez vous assurer de les prendre comme indiqué.

Traitement

Les chlamydiae sont sensibles aux antibiotiques qui inhibent la synthèse des protéines tels que les tétracyclines et les macrolides. Agent pathogène : Ces infections causées par des bactéries (chlamydia trachomatis). L'azithromycine et la doxycycline sont des antibiotiques recommandés pour le traitement de la chlamydia ; mais tout souci vaut mieux aller dans un centre de santé pour être évalué par un spécialiste.

Notes et références

  1. ↑ Ryan KJ, Ray CG (éditeurs) (2004). Sherris Medical Microbiology (4e édition). McGraw Hill. pp. 463-70. ISBN  0-8385-8529-9 . 
  2. ^ "CDC - Trachome, Maladies liées à l'hygiène, Eau saine" . Centre de contrôle des maladies. 28 décembre 2009. Archivé de l'original le 5 septembre 2015 . Consulté le 24 juillet 2015 . 
  3. ↑ Ward M. "Diagramme de taxonomie" . Chlamydiae.com . Archivé de l'original le 18 septembre 2010 . Récupéré le 28 octobre 2008 . 
  4. ^ "Copie archivée" . Archivé de l'original le 7 avril 2007 . Consulté le 17 avril 2007 . 
  5. ^ "Chlamydia trachomatis" . Archivé de l'original le 2 juillet 2010 . Consulté le 18 juin 2010 . 
  6. ↑ Partie, AC " Genre Chlamydophila " . Liste des noms procaryotes avec statut dans la nomenclature . Consulté le 4 avril 2020 . 
  7. ↑ « Diagramme des taxons » (en anglais) . 
  8. ^ "Génomes bactériens EMBL" . Récupéré le 19/01/2012 . 
  9. ^ "Taxonomie des Chlamydia et Chlamydales " . 
  10. ↑ a b Sachse, Konrad ; Bavoil, Patrik M.; Kaltenboeck, Bernhard; Stephens, Richard S.; Kuo, Cho-Chou ; Rossello-Mora, Ramon; Horn, Matthias (mars 2015). « Émendation de la famille Chlamydiaceae : proposition d'un seul genre, Chlamydia, pour inclure toutes les espèces actuellement reconnues » . Microbiologie systématique et appliquée (en anglais) 38 (2): 99-103. PMID  25618261 . doi : 10.1016/j.syapm.2014.12.004 . Consulté le 4 avril 2020 . 
  11. ↑ Kuo, Cho-Chou ; Stephens, Richard S.; Bavoil, Patrick M.; Kaltenboeck, Bernhard (14 septembre 2015). [Manuel de Bergey sur la systématique des archées et des bactéries "Chlamydia"] incorrect ( aide ) . Manuel de Bergey de Systématique des Archaea et des Bactéries : 1-28. doi : 10.1002/9781118960608.gbm00364 . Consulté le 4 avril 2020 . |url=  
  12. ^ "Protection contre la chlamydia" . Consulté le 1er août 2010 . 

Bibliographie

  • Ausina Ruiz V & Sabrià Leal M (2000). Infections causées par la chlamydia. Dans Farreras Valentí P & Rozman C : Médecine interne , (2)303 :2694-2699, 14a. éd. Madrid : Harcourt.
  • Bush RM et Everett KDE (2001). Evolution moléculaire des Chlamydiaceae. Int J. Syst. évolu. microbiol. 51:203-220.
  • Everett KDE, Bush RM et Andersen AA (1999). Description modifiée de l'ordre Chlamydiales, proposition de Parachlamydiaceae fam. nov. et Simkaniacées fam. nov., contenant chacun un genre monotypique, une taxonomie révisée de la famille des Chlamydiaceae, comprenant un nouveau genre et cinq nouvelles espèces, et des normes pour l'identification des organismes. Journal international de microbiologie systématique et évolutive , (2)49:415-440. ( PDF )
  • Everett KDE et Andersen AA (2001). Des changements radicaux dans la taxonomie des chlamydia ne sont pas encore nécessaires - répondez. International J. of Systematic and Evolutionary Microbiology , 51, 250.
  • Schachter J, Stephens RS, Timms P, Kuo C, Bavoil PM, Birkelund S, Boman J, Caldwell H, Campbell LA, Chernesky M, Christiansen G, Clarke IN, Gaydos C, Grayston JT, Hackstadt T, Hsia R, Kaltenboeck B , Leinonnen M, Ocjius D, McClarty G, Orfila J, Peeling R, Puolakkainen M, Quinn T, Rank RG, Raulston J, Ridgeway GL, Saikku P, Stamm WE, Taylor-Robinson D, Wang SP et Wyrick PB (2001) . Des changements radicaux dans la taxonomie des chlamydia ne sont pas encore nécessaires. International J. of Systematic and Evolutionary Microbiology 51, 249.
  • Aperçu taxonomique des procaryotes, Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, deuxième édition version 1.0, avril 2001. [1]

Liens externes

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