SHANK2 - SHANK2

SHANK2
Identifikatorer
Aliaser	SHANK2 , AUTS17, CORTBP1, CTTNBP1, ProSAP1, SHANK, SPANK-3, SH3 og flere ankyrin-gentagelsesdomæner 2
Eksterne ID'er	OMIM : 603290 MGI : 2671987 HomoloGene : 105965 GeneCards : SHANK2
Genplacering ( menneske )
Chr.	Kromosom 11 (menneske)
Ende	71.252.577 bp
Gen placering ( mus )
Chr.	Kromosom 7 (mus)
Ende	144.424.494 bp
RNA -udtryksmønster
	; ; ; ;
	Flere referenceudtryksdata
Genontologi
Molekylær funktion	• SH3 -domænebinding ; • GO: 0001948 proteinbinding ; • synaptisk receptoradapteraktivitet ; • ionotropisk glutamatreceptorbinding ; • signalering af receptorkompleks adapteraktivitet;
Cellulær komponent	• cytoplasma ; • postsynaptisk membran ; • celleprojektion ; • membran ; • GO: 0097483, GO: 0097481 postsynaptisk densitet ; • neurofilament ; • fotoreceptors indre segment ; • vækstkegle ; • plasmamembran ; • dendritisk rygsøjle ; • fotoreceptors ydre segment ; • synapse ; • børstegrænsemembran ; • celleforbindelse ; • neuronal cellelegeme ; • apikal plasmamembran ; • ciliarmembran ; • neuronprojektion ; • ionotropisk glutamatreceptorkompleks ; • cytosol ; • cellulær komponent ; • dendrit ; • neuronrygge;
Biologisk proces	• indlæring ; • vokaliseringsadfærd ; • voksen adfærd ; • langvarig synaptisk depression ; • social adfærd ; • synapssamling ; • langvarig synaptisk potentiering ; • hjernemorfogenese ; • synaptisk samling ved neuromuskulært kryds ; • positiv regulering af synaptisk transmission, glutamatergisk ; • dendritisk morfogenese i rygsøjlen ; • positiv regulering af dendritisk rygudvikling ; • postsynaptisk densitetssamling ; • regulering af AMPA -receptoraktivitet ; • positiv regulering af excitatorisk postsynaptisk potentiale;
	Kilder: Amigo / QuickGO
Ortologer
	22941
	210274
	ENSG00000162105
	ENSMUSG00000037541
	Q9UPX8
	Q80Z38
	NM_012309 ; NM_133266 ; NM_001379226
	NM_001081370 ; NM_001113373
	NP_036441 ; NP_573573 ; NP_001366155
	NP_001074839 ; NP_001106844
	Wikidata
Se/rediger menneske	Se/rediger mus

SH3 og multiple ankyrin -gentagelsesdomæner protein 2 er et protein, der hos mennesker er kodet af SHANK2 -genet . To alternative splejsningsvarianter, der koder for forskellige isoformer , er rapporteret. Yderligere splejsningsvarianter findes, men deres fulde længde er ikke blevet bestemt.

Fungere

Dette gen koder for et protein, der er medlem af Shank -familien af synaptiske proteiner, der kan fungere som molekylære stilladser i den postsynaptiske densitet (PSD). Shank-proteiner indeholder flere domæner til protein-protein-interaktion, herunder ankyrin-gentagelser , et SH3-domæne , et PSD-95 /Dlg /ZO-1-domæne, et sterilt alfamotivdomæne og en prolinrig region. Dette særlige familiemedlem indeholder et PDZ-domæne , en konsensus-sekvens for cortactin SH3-domænebindende peptider og et sterilt alfa-motiv. Den alternative splejsning demonstreret i Shank-gener er blevet foreslået som en mekanisme til regulering af Shank's molekylære struktur og spektret af Shank-interagerende proteiner i PSD'erne hos voksen og udviklende hjerne.

Det menes, at SHANK2 kan spille en rolle i synaptogenese ved at vedhæfte metabotrope glutamatreceptorer (mGluR'er) til en eksisterende pulje af NMDA-receptorer (NMDA-R) ved at linke til NMDA-R gennem PSD-95 og mGluR'erne gennem HOMER1 . En alternativ hypotese er, at Homer/Shank/GKAP/PSD-95-samlingen medierer fysisk association af NMDAR med IP3R/RYR og intracellulære Ca2+ -butikker.

Interaktioner

SHANK2 har vist sig at interagere med:

Foreninger med neuropsykiatrisk sygdom

Mutationer i SHANK2 har været forbundet med autismespektrumforstyrrelse (ASD) og skizofreni. Især har heterozygote tab af funktionsmutationer en næsten fuldstændig penetration i ASD. Neuroner genereret fra mennesker med ASD- og SHANK2 -mutationer udvikler større dendritiske træer og flere synaptiske forbindelser end dem fra raske kontroller. Derudover er almindelige mutationer i SHANK2 blevet knyttet til bipolar lidelse .

Referencer

Yderligere læsning

Sheng M, Kim E (juni 2000). "Shank -familien af stilladsproteiner". Journal of Cell Science . 113. 113 (Pt 11): 1851–6. PMID 10806096 .
Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (april 1996). "En" dobbelt adapter "metode til forbedret haglgeværbibliotekskonstruktion". Analytisk biokemi . 236 (1): 107–13. doi : 10.1006/abio.1996.0138 . PMID 8619474 .
Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, et al. (April 1997). "Storskala sammenkædnings-cDNA-sekventering" . Genomforskning . 7 (4): 353–8. doi : 10.1101/gr.7.4.353 . PMC 139146 . PMID 9110174 .
Du Y, Weed SA, Xiong WC, Marshall TD, Parsons JT (oktober 1998). "Identifikation af et nyt cortactin SH3-domænebindende protein og dets lokalisering til vækstkegler af dyrkede neuroner" . Molekylær og cellulær biologi . 18 (10): 5838–51. doi : 10.1128/MCB.18.10.5838 . PMC 109170 . PMID 9742101 .
Zitzer H, Richter D, Kreienkamp HJ (juni 1999). "Agonistafhængig interaktion mellem rotte-somatostatinreceptorsubtype 2 med cortactinbindende protein 1" . Journal of Biological Chemistry . 274 (26): 18153–6. doi : 10.1074/jbc.274.26.18153 . PMID 10373412 .
Tu JC, Xiao B, Naisbitt S, Yuan JP, Petralia RS, Brakeman P, et al. (Juli 1999). "Kobling af mGluR/Homer- og PSD-95-komplekser af Shank-familien af postsynaptiske densitetsproteiner" . Neuron . 23 (3): 583–92. doi : 10.1016/S0896-6273 (00) 80810-7 . PMID 10433269 . S2CID 16429070 .
Kikuno R, Nagase T, Ishikawa K, Hirosawa M, Miyajima N, Tanaka A, et al. (Juni 1999). "Forudsigelse af de kodende sekvenser af uidentificerede humane gener. XIV. De komplette sekvenser af 100 nye cDNA -kloner fra hjernen, som koder for store proteiner in vitro" . DNA -forskning . 6 (3): 197–205. doi : 10.1093/dnares/6.3.197 . PMID 10470851 .
Boeckers TM, Winter C, Smalla KH, Kreutz MR, Bockmann J, Seidenbecher C, et al. (Oktober 1999). "Proline-rige synaps-associerede proteiner ProSAP1 og ProSAP2 interagerer med synaptiske proteiner fra SAPAP/GKAP-familien". Biokemisk og biofysisk forskningskommunikation . 264 (1): 247–52. doi : 10.1006/bbrc.1999.1489 . PMID 10527873 .
Kreienkamp HJ, Zitzer H, Gundelfinger ED, Richter D, Bockers TM (oktober 2000). "Den calciumuafhængige receptor for alfa-latrotoxin fra hjerne fra mennesker og gnavere interagerer med medlemmer af ProSAP/SSTRIP/Shank-familien af multidomainproteiner" . Journal of Biological Chemistry . 275 (42): 32387–90. doi : 10.1074/jbc.C000490200 . PMID 10964907 .
Kreienkamp HJ, Zitzer H, Richter D (2001). "Identifikation af proteiner, der interagerer med rotten somatostatinreceptorsubtype 2". Journal of Physiology, Paris . 94 (3–4): 193–8. doi : 10.1016/S0928-4257 (00) 00204-7 . PMID 11087996 . S2CID 8791865 .
Okamoto PM, Gamby C, Wells D, Fallon J, Vallee RB (december 2001). "Dynamin isoform-specifik interaktion med skaftet/ProSAP-stilladsproteinerne i den postsynaptiske densitet og actincytoskelet" . Journal of Biological Chemistry . 276 (51): 48458–65. doi : 10.1074/jbc.M104927200 . PMC 2715172 . PMID 11583995 .
Soltau M, Richter D, Kreienkamp HJ (december 2002). "Insulinreceptorsubstratet IRSp53 forbinder postsynaptisk skaft1 med det lille G-protein cdc42". Molekylær og cellulær neurovidenskab . 21 (4): 575–83. doi : 10.1006/mcne.2002.1201 . PMID 12504591 . S2CID 572407 .
Park E, Na M, Choi J, Kim S, Lee JR, Yoon J, et al. (Maj 2003). "Shank -familien af postsynaptiske densitetsproteiner interagerer med og fremmer synaptisk akkumulering af beta PIX guanin -nukleotidudvekslingsfaktoren for Rac1 og Cdc42" . Journal of Biological Chemistry . 278 (21): 19220–9. doi : 10.1074/jbc.M301052200 . PMID 12626503 .
Han W, Kim KH, Jo MJ, Lee JH, Yang J, Doctor RB, et al. (Januar 2006). "Shank2 associerer med og regulerer Na+/H+ veksler 3" . Journal of Biological Chemistry . 281 (3): 1461–9. doi : 10.1074/jbc.M509786200 . PMID 16293618 .
Taylor TD, Noguchi H, Totoki Y, Toyoda A, Kuroki Y, Dewar K, et al. (Marts 2006). "Humant kromosom 11 DNA -sekvens og analyse inklusive ny genidentifikation" . Natur . 440 (7083): 497–500. doi : 10.1038/nature04632 . PMID 16554811 .

Eksterne links

SHANK2 Fonden - nonprofit -støttende familier og forskning i SHANK2 lidelser

Denne artikel om et gen på humant kromosom 11 er en stub . Du kan hjælpe Wikipedia ved at udvide den .

Languages

In other projects