miRBase - miRBase
 | |
|---|---|
| Indhold | |
| Beskrivelse | microRNA-database |
| Kontakt | |
| Forskningscenter | University of Manchester |
| Forfattere | Ana Kozomara |
| Primær henvisning | Kozomara & al. (2011) |
| Udgivelses dato | 2010 |
| Adgang | |
| Internet side | www |
I bioinformatik er miRBase en biologisk database, der fungerer som et arkiv med mikroRNA- sekvenser og -noteringer. Fra september 2010 indeholdt den information om 15.172 mikroRNA'er. Dette tal er steget til 38.589 i marts 2018. miRBase-registreringsdatabasen tilvejebringer et centraliseret system til tildeling af nye navne til microRNA-gener.
miRBase voksede fra mikroRNA-registerressourcen oprettet af Sam Griffiths-Jones i 2003.
Ifølge Ana Kozomara og Sam Griffiths-Jones har miRBase fem mål:
- At give et ensartet navnesystem til microRNA'er
- At give et centralt sted, der samler alle kendte microRNA-sekvenser
- At give information, der kan læses af mennesker og computere til hver microRNA
- At levere primært bevis for hvert microRNA
- At samle og linke til microRNA-målinformation
MiRBase indeholder miRNA'er, der tilhører forskellige arter, der tilhører Alveolata , Chromalveolata , Metazoa , Mycetozoa , Viridiplantae og Virus . For Viridiplantae er der i frigivelse 21 (2014) data tilgængelige for 73 arter . Dette inkluderer 4800 unikke modne miRNA'er og 8480 forløbersekvenser.
Den aktuelle version af MiRBase er udgivelse 22 (marts 2018).
Referencer
eksterne links
 |
Denne biologiske database- relaterede artikel er en stub . Du kan hjælpe Wikipedia ved at udvide den . |
