miRBase - miRBase

miRBase
MiRBase logo.png
Conteúdo
Descrição banco de dados microRNA
Contato
Centro de Pesquisa Universidade de Manchester
Autores Ana kozomara
Citação primária Kozomara e outros (2011)
Data de lançamento 2010
Acesso
Local na rede Internet www .mirbase .org

Em bioinformática , miRBase é um banco de dados biológico que atua como um arquivo de sequências e anotações de microRNA . Em setembro de 2010, continha informações sobre 15.172 microRNAs. Esse número subiu para 38.589 em março de 2018. O registro miRBase fornece um sistema centralizado para atribuir novos nomes a genes de microRNA.

miRBase cresceu a partir do recurso de registro de microRNA criado por Sam Griffiths-Jones em 2003.

De acordo com Ana Kozomara e Sam Griffiths-Jones, miRBase tem cinco objetivos:

  1. Para fornecer um sistema de nomenclatura consistente para microRNAs
  2. Para fornecer um local central para coletar todas as sequências de microRNA conhecidas
  3. Para fornecer informações legíveis por humanos e por computador para cada microRNA
  4. Para fornecer evidências primárias para cada microRNA
  5. Para agregar e vincular às informações de destino de microRNA

MiRBase contém miRNAs pertencentes a várias espécies pertencentes a Alveolata , Chromalveolata , Metazoa , Mycetozoa , Viridiplantae e Viruses . Para o Viridiplantae , na versão 21 (2014) estão disponíveis dados para 73 espécies . Isso inclui 4800 miRNAs maduros exclusivos e 8.480 sequências precursoras.

A versão atual do MiRBase é a versão 22 (março de 2018).

Referências

links externos