Vnitřní smyčka - Internal loop
Vnitřní smyčky (také nazývané vnitřní smyčky) v RNA se nalézají tam, kde se dvouřetězcová RNA odděluje v důsledku žádného párování bází Watson-Crick-Franklin mezi nukleotidy . Vnitřní smyčky se liší od smyček kmenových, protože se vyskytují uprostřed úseku dvouvláknové RNA. Zbytky, které nejsou kanonické, mají za následek zkreslení dvojité šroubovice v důsledku odvíjení, rozbalování a zauzlování.
Vnitřní smyčky lze klasifikovat jako symetrické nebo asymetrické, přičemž některé asymetrické vnitřní smyčky, známé také jako boule. Mnoho důležitých strukturálních motivů se skládá z vnitřních smyček, jako je smyčka C, dokovací koleno, smyčky zalomení (k-otočení), pravý úhel, smyčky sarcin / ricin (také nazývané vypouklé G motivy), zkroucený motiv a motiv vnitřní smyčky UAA / GAN.
