Interolog - Interolog
Interolog является сохраняющимся взаимодействием между парой белков , которые имеют взаимодействующие гомологи в другом организме. Этот термин был введен в 2000 г. в статье Walhout et al.
пример
Предположим, что A и B - два разных взаимодействующих белка человека, а A 'и B' - два разных взаимодействующих белка собаки. Тогда взаимодействие между A и B является интерологом взаимодействия между A 'и B', если выполняются все следующие условия:
- A - гомолог A '. (Гомологи белков имеют сходные аминокислотные последовательности и происходят от общей предковой последовательности).
- B является гомологом B '.
- A и B взаимодействуют.
- A 'и B' взаимодействуют.
Таким образом, интерологи представляют собой пары гомологичных белковых взаимодействий между разными организмами.
Смотрите также
Рекомендации
- Yu, H .; Ласкомб, Нью-Мексико; Лу, HX; Чжу, X .; Xia, Y .; Han, JD; Bertin, N .; Chung, S .; Vidal, M .; Герштейн, М. (2004). «Перенос аннотации между геномами: интерологи белок-белок и регулоги белок-ДНК» . Геномные исследования . 14 (6): 1107–1118. DOI : 10.1101 / gr.1774904 . PMC 419789 . PMID 15173116 .
- Kemmer, D .; Huang, Y .; Шах, ИП; Lim, J .; Brumm, J .; Юэнь, ММ; Ling, J .; Xu, T .; Вассерман, WW; Уэллетт, Б.Ф. (2005). «Ulysses - приложение для проектирования молекулярных взаимодействий между видами» . Геномная биология . 6 (12): R106. DOI : 10.1186 / GB-2005-6-12-R106 . PMC 1414088 . PMID 16356269 .
- Уайлс, AM; Додерер, М .; Ruan, J .; Гу, ТТ; Ravi, D .; Blackman, B .; Бишоп, AJ (2010). «Построение и анализ сетей взаимодействия белков путем межвидовых сравнений» . BMC Системная биология . 4 : 36. DOI : 10,1186 / 1752-0509-4-36 . PMC 2859380 . PMID 20353594 .
внешние ссылки
- Interactome.org : сайт портала Interactome.
- Interactomics.org : сайт портала Interactomics.
- [1] : сайт прогнозирования межвидового взаимодействия.
 
|
Эта статья по биоинформатике незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |
