Interolog - Interolog
En interolog er en konserveret interaktion mellem et par proteiner, der har interagerende homologer i en anden organisme. Udtrykket blev introduceret i et papir fra 2000 af Walhout et al.
Eksempel
Antag at A og B er to forskellige interagerende humane proteiner, og A 'og B' er to forskellige interagerende hundeproteiner. Derefter er interaktionen mellem A og B en interolog af interaktionen mellem A 'og B', hvis følgende betingelser alle gælder:
- A er en homolog for A '. (Proteinhomologer har lignende aminosyresekvenser og stammer fra en fælles forfædresekvens).
- B er en homolog af B '.
- A og B interagerer.
- A 'og B' interagerer.
Således er interologer homologe par af proteininteraktioner på tværs af forskellige organismer.
Se også
Referencer
- Yu, H .; Luscombe, NM; Lu, HX; Zhu, X .; Xia, Y .; Han, JD; Bertin, N .; Chung, S .; Vidal, M .; Gerstein, M. (2004). "Kommentaroverførsel mellem genomer: Protein-protein-interologer og protein-DNA-reguleringer" . Genomforskning . 14 (6): 1107–1118. doi : 10.1101 / gr.1774904 . PMC 419789 . PMID 15173116 .
- Kemmer, D .; Huang, Y .; Shah, SP; Lim, J .; Brumm, J .; Yuen, MM; Ling, J .; Xu, T .; Wasserman, WW; Ouellette, BF (2005). "Ulysses - en applikation til projektion af molekylære interaktioner på tværs af arter" . Genombiologi . 6 (12): R106. doi : 10.1186 / gb-2005-6-12-r106 . PMC 1414088 . PMID 16356269 .
- Wiles, AM; Doderer, M .; Ruan, J .; Gu, TT; Ravi, D .; Blackman, B .; Bishop, AJ (2010). "Opbygning og analyse af protein-interaktive netværk ved sammenligning mellem arter" . BMC Systems Biology . 4 : 36. doi : 10.1186 / 1752-0509-4-36 . PMC 2859380 . PMID 20353594 .
eksterne links
- Interactome.org : Interactome-portalwebsted.
- Interactomics.org : Interactomics portalwebsted.
- [1] : Forudsigelsessted på tværs af arter.
 
|
Denne bioinformatik-relaterede artikel er en stub . Du kan hjælpe Wikipedia ved at udvide den . |
