Mikromacierz tkankowa - Tissue microarray
Mikromacierze tkankowe (również TMA ) składają się z bloków parafiny, w których do 1000 oddzielnych rdzeni tkankowych jest połączonych w sposób macierzowy, aby umożliwić multipleksową analizę histologiczną .
Historia
Główne ograniczenia w molekularnej analizie klinicznej tkanek obejmują uciążliwy charakter procedur, ograniczoną dostępność odczynników diagnostycznych i ograniczoną wielkość próbki pacjenta. Aby rozwiązać te problemy, opracowano technikę mikromacierzy tkankowej.
Bloki wielotkankowe zostały po raz pierwszy wprowadzone przez H. Battifora w 1986 r. Wraz z jego tak zwanym „blokiem tkanki wieloguzowej (kiełbasy)" i zmodyfikowane w 1990 r. Poprzez jego ulepszenie „blok tkanki szachownicy". W 1998 r. J. Kononen i współpracownicy opracowali obecna technika, która wykorzystuje nowatorskie podejście do pobierania próbek do produkcji tkanek o regularnych rozmiarach i kształtach, które można rozmieścić w gęstszy i dokładniejszy sposób.
Procedura
W technice mikromacierzy tkankowej pusta igła jest używana do usuwania rdzeni tkankowych o średnicy zaledwie 0,6 mm z interesujących obszarów tkanek zatopionych w parafinie, takich jak biopsje kliniczne lub próbki guza . Te rdzenie tkankowe są następnie umieszczane w bloku parafiny przyjmującej w precyzyjnie rozmieszczonym układzie. Skrawki z tego bloku wycina się za pomocą mikrotomu , osadza na szkiełku mikroskopowym, a następnie analizuje dowolną metodą standardowej analizy histologicznej. Każdy blok mikromacierzy można pociąć na 100 - 500 odcinków, które można poddać niezależnym testom. Testy powszechnie stosowane w mikromacierzy tkankowej obejmują immunohistochemię i fluorescencyjną hybrydyzację in situ . Mikromacierze tkankowe są szczególnie przydatne w analizie próbek raka .
Jedną z odmian jest macierz tkanek Frozen .
Użyj w badaniach
Zastosowanie mikromacierzy tkankowych w połączeniu z immunohistochemią jest preferowaną metodą badania i walidacji biomarkerów raka w różnych zdefiniowanych kohortach pacjentów z rakiem . Możliwość zebrania dużej liczby reprezentatywnych próbek raka z określonej kohorty pacjentów, która ma również odpowiednią kliniczną bazę danych, stanowi potężne źródło informacji do badania, w jaki sposób różne wzorce ekspresji białek korelują z różnymi parametrami klinicznymi. Ponieważ próbki pacjentów są składane w tym samym bloku, skrawki można barwić zgodnie z tym samym protokołem, aby uniknąć zmienności eksperymentalnej i artefaktów technicznych. Kliniczne kohorty pacjentów z rakiem i odpowiadające im zestawy mikromacierzy tkankowych zostały wykorzystane do badania diagnostycznych, prognostycznych i terapeutycznych biomarkerów raka w większości postaci raka, w tym raka płuc, piersi, jelita grubego i nerki.
Immunohistochemię w połączeniu z mikromacierzami tkankowymi z powodzeniem stosowano również w wysiłkach na dużą skalę w celu stworzenia mapy ekspresji białek na bardziej globalną skalę.
Zobacz też
Bibliografia
- Battifora H: Blok tkanki wieloguzowej (kiełbasy): nowa metoda immunohistochemicznego testowania przeciwciał. Lab Invest 1986, 55: 244-248.
- Battifora H, Mehta P: Blok tkanki w szachownicę. Ulepszony blok sterowania wielopunktowego. Lab Invest 1990, 63: 722-724.
- Kononen J, Bubendorf L, Kallioniemi A, Barlund M, Schraml P, Leighton S, Torhorst J, Mihatsch MJ, Sauter G, Kallioniemi OP: Tissue microarrays do wysokowydajnego molekularnego profilowania próbek guza. Nat Med 1998, 4: 844-847.
Linki zewnętrzne
-
Media związane z mikromacierzą tkankową w Wikimedia Commons - Program badań macierzy tkankowych National Cancer Institute
