EEGLAB - EEGLAB

EEGLAB er en MATLAB -verktøykasse distribuert under gratis BSD -lisens for behandling av data fra elektroencefalografi (EEG), magnetoencefalografi (MEG) og andre elektrofysiologiske signaler. Sammen med alle de grunnleggende behandlingsverktøyene implementerer EEGLAB uavhengig komponentanalyse (ICA), analyse av tid/frekvens, avvisning av artefakter og flere datavisualiseringsmetoder. EEGLAB lar brukerne importere sine elektrofysiologiske data i omtrent 20 binære filformater, forhåndsbehandle dataene, visualisere aktivitet i enkeltforsøk og utføre ICA. Artifaktuelle ICA -komponenter kan trekkes fra dataene. Alternativt kan ICA -komponenter som representerer hjerneaktivitet behandles og analyseres ytterligere. EEGLAB lar brukerne også gruppere data fra flere emner og gruppere sine uavhengige komponenter.

Historie

I 1997 ble et sett med databehandlingsfunksjoner først utgitt på Internett av Scott Makeig i Computational Neurobiology Laboratory regissert av Terry Sejnowski ved Salk Institute , under navnet "ICA/EEG toolbox". I 2000 designet Arnaud Delorme et grafisk brukergrensesnitt på toppen av disse funksjonene sammen med noen av sine egne artefaktfjerningsfunksjoner, og ga ut den første versjonen av "EEGLAB -programvaren for fjerning av artefakter". I 2003 sluttet Delorme og Makeig seg til arbeidet med å gi ut den første stabile og fullt dokumenterte versjonen av EEGLAB. I 2004 ble EEGLAB tildelt finansiering av NIH for fortsatt utvikling av forskningsprogramvare.

Statistikk

EEGLAB ble lastet ned omtrent 25 000 ganger fra 73 land over hele verden de første tre årene (2003–2006), og i 2011 ble det rapportert å være det mest brukte signalbehandlingsmiljøet for behandling av EEG -data av kognitive nevrovitenskapsmenn ( undersøkelsesresultater ). Referansepapiret (Delorme & Makeig, 2004) har mottatt over 12 400 sitater (02/2013).

EEGLAB består av over 380 frittstående MATLAB-funksjoner og over 50 000 kodelinjer og er vert for over 20 brukerbidrag. Betydelige plug-in verktøykasser fortsetter å bli skrevet og publisert av forskere ved Swartz Center, UCSD og av mange andre grupper. Store plug-ins inkluderer:

• DIPFIT, for kildelokalisering av ICA -komponentkilder til EEG -data;
• ERPLAB , for å utlede tiltak fra gjennomsnittlige hendelsesrelaterte potensialer;
• RASKERE , en helautomatisk, uten tilsyn metode for behandling av EEG -data med høy tetthet;
• NBT , en verktøykasse for beregning og integrering av nevrofysiologiske biomarkører;
• NFT , for å bygge elektriske fremoverhodemodeller fra MR -bilder og/eller elektrodeposisjoner;
• SIFT , en kildeinformasjonsflyt -verktøykasse;
• BCILAB , et omfattende miljø for å bygge og teste modeller mellom hjerne og datamaskin ;

Hundrevis av forskere har bidratt direkte eller indirekte til programvaren ved å programmere funksjoner eller rapportere feil. Den nåværende eeglablist -e -postdiskusjonslisten har over 5000 medlemmer over hele verden (2013).

Se også

EEGLAB -hjemmesiden ;

Kilder

Hovedreferanse:

• Delorme, Arnaud; Makeig, Scott (2004). "EEGLAB: en åpen kildekode-verktøykasse for analyse av enkelt-prøve EEG-dynamikk inkludert uavhengig komponentanalyse". Journal of Neuroscience Methods . Elsevier BV. 134 (1): 9–21. doi : 10.1016/j.jneumeth.2003.10.009 . ISSN  0165-0270 . PMID  15102499 . S2CID  1101322 .

Teori:

• Jung, Tzyy-Ping; Makeig, Scott; Bell, Anthony J .; Sejnowski, Terrence J. (1998). "Uavhengig komponentanalyse av elektroencefalografiske og hendelsesrelaterte potensielle data". Sentral auditiv behandling og nevral modellering (PDF) . Boston, MA: Springer USA. doi : 10.1007/978-1-4615-5351-9_17 . ISBN 978-1-4613-7441-1.
• Makeig, Scott; Debener, Stefan; Onton, Julie; Delorme, Arnaud (2004). "Gruvehendelsesrelatert hjernedynamikk". Trender innen kognitive vitenskaper . Elsevier BV. 8 (5): 204–210. doi : 10.1016/j.tics.2004.03.008 . ISSN  1364-6613 . PMID  15120678 . S2CID  1649275 .
• Delorme, Arnaud; Palmer, Jason; Onton, Julie; Oostenveld, Robert; Makeig, Scott (2012-02-15). Ward, Lawrence M. (red.). "Uavhengige EEG -kilder er dipolare" . PLOS ONE . Public Library of Science (PLoS). 7 (2): e30135. doi : 10.1371/journal.pone.0030135 . ISSN  1932-6203 . PMC  3280242 . PMID  22355308 .
• Makeig, S .; Kothe, C .; Mullen, T .; Bigdely-Shamlo, N .; Kreutz-Delgado, Kenneth (2012). "Utvikling av signalbehandling for hjerne - datamaskingrensesnitt" . Saksbehandling av IEEE . Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE). 100 (Special Centennial Issue): 1567–1584. doi : 10.1109/jproc.2012.2185009 . ISSN  0018-9219 .

Verktøykasser:

• Zeynep Akalin Acar & Scott Makeig, Neuroelectromagnetic Forward Head Modeling Toolbox J Neurosci Meth doi: 10.1016/jneumeth.2010.04.031 (2010)
• Nolan, H., Whelan, R., & Reilly, RB "RASKERE: Fullstendig automatisert statistisk terskel for EEG -artefaktavvisning". Journal of Neuroscience Methods 192 (1): 152–162 (2010)
• Delorme, A., Mullen, T., Kothe, C., Bigdely-Shamlo, N., Akalin, Z., Vankov, A., Makeig, S. EEGLAB, MPT, NetSIFT, NFT, BCILAB og ERICA: Ny verktøy for avansert EEG/MEG -behandling. Computational Intelligence, artikkel -ID 130714 (2011)
• N Bigdely-Shamlo, T. Mullen, K. Kreutz-Delgado, S Makeig. Mål projiseringsanalyse: En sannsynlig tilnærming til EEG-kildesammenligning og multifaglige slutninger. doi: //10.1016/j.neuroimage.2013.01.040 (2013)

Eksterne linker

• EEGLAB -side ved Swartz Center for Computational Neuroscience