EEGLAB - EEGLAB

EEGLAB è un toolbox MATLAB distribuito con licenza BSD gratuita per l'elaborazione di dati da elettroencefalografia (EEG), magnetoencefalografia (MEG) e altri segnali elettrofisiologici. Insieme a tutti gli strumenti di elaborazione di base, EEGLAB implementa l'analisi dei componenti indipendenti (ICA), l'analisi tempo/frequenza, il rifiuto degli artefatti e diverse modalità di visualizzazione dei dati. EEGLAB consente agli utenti di importare i propri dati elettrofisiologici in circa 20 formati di file binari, preelaborare i dati, visualizzare l'attività in singole prove ed eseguire ICA. I componenti ICA artefatti possono essere sottratti dai dati. In alternativa, i componenti ICA che rappresentano l'attività cerebrale possono essere ulteriormente elaborati e analizzati. EEGLAB consente inoltre agli utenti di raggruppare dati provenienti da più soggetti e di raggruppare i loro componenti indipendenti.

Storia

Nel 1997, una serie di funzioni di elaborazione dati è stata rilasciata per la prima volta su Internet da Scott Makeig nel Computational Neurobiology Laboratory diretto da Terry Sejnowski presso il Salk Institute , sotto il nome di "the ICA/EEG toolbox". Nel 2000, Arnaud Delorme ha progettato un'interfaccia utente grafica oltre a queste funzioni insieme ad alcune delle sue funzioni di rimozione degli artefatti e ha rilasciato la prima versione del "software EEGLAB per la rimozione degli artefatti". Nel 2003, Delorme e Makeig hanno unito gli sforzi per rilasciare la prima versione stabile e completamente documentata di EEGLAB. Nel 2004, EEGLAB ha ricevuto un finanziamento dal NIH per lo sviluppo continuo di software di ricerca.

Statistiche

EEGLAB è stato scaricato circa 25.000 volte da 73 paesi in tutto il mondo nei suoi primi tre anni (2003-2006) e nel 2011 è stato segnalato come l'ambiente di elaborazione del segnale più utilizzato per l'elaborazione dei dati EEG dai neuroscienziati cognitivi ( risultati del sondaggio ). Il suo documento di riferimento (Delorme & Makeig, 2004) ha ricevuto oltre 12.400 citazioni (02/2013).

EEGLAB comprende oltre 380 funzioni MATLAB autonome e oltre 50.000 righe di codice e ospita oltre 20 plug-in forniti dall'utente. Significativi toolbox plug-in continuano ad essere scritti e pubblicati dai ricercatori dello Swartz Center, UCSD, e da molti altri gruppi. I principali plug-in includono:

• DIPFIT, per la localizzazione delle sorgenti dei componenti ICA dei dati EEG;
• ERPLAB , per ricavare misure da potenziali eventi medi;
• FASTER , un metodo completamente automatizzato e non supervisionato per l'elaborazione di dati EEG ad alta densità;
• NBT , un toolbox per il calcolo e l'integrazione di biomarcatori neurofisiologici;
• NFT , per la costruzione di modelli elettrici della testa anteriore da immagini RM e/o posizioni degli elettrodi;
• SIFT , una cassetta degli attrezzi per il flusso di informazioni sulla fonte;
• BCILAB , un ampio ambiente per costruire e testare modelli di interfaccia cervello-computer ;

Centinaia di ricercatori hanno contribuito direttamente o indirettamente al software programmando funzioni o segnalando bug. L'attuale elenco di discussione e-mail di eeglablist ha oltre 5.000 membri in tutto il mondo (2013).

Guarda anche

La home page di EEGLAB ;

Fonti

Riferimento principale:

• Delorme, Arnaud; Makeig, Scott (2004). "EEGLAB: una cassetta degli attrezzi open source per l'analisi delle dinamiche EEG a prova singola inclusa l'analisi dei componenti indipendenti". Giornale dei metodi di neuroscienza . Elsevier BV. 134 (1): 9-21. doi : 10.1016/j.jneumeth.2003.10.009 . ISSN  0165-0270 . PMID  15102499 . S2CID  1101322 .

Teoria:

• Jung, Tzyy-Ping; Makeig, Scott; Bell, Anthony J.; Sejnowski, Terrence J. (1998). "Analisi dei componenti indipendenti dei dati potenziali elettroencefalografici e relativi agli eventi". Elaborazione uditiva centrale e modellazione neurale (PDF) . Boston, MA: Springer USA. doi : 10.1007/978-1-4615-5351-9_17 . ISBN 978-1-4613-7441-1.
• Makeig, Scott; Debener, Stefan; Onton, Julie; Delorme, Arnaud (2004). "Dinamiche cerebrali legate all'evento minerario". Tendenze nelle scienze cognitive . Elsevier BV. 8 (5): 204-210. doi : 10.1016/j.tics.2004.03.008 . ISSN  1364-6613 . PMID  15120678 . S2CID  1649275 .
• Delorme, Arnaud; Palmer, Jason; Onton, Julie; Oosteveld, Robert; Makeig, Scott (2012-02-15). Ward, Lawrence M. (ed.). "Le sorgenti EEG indipendenti sono dipolari" . PLOS UNO . Biblioteca Pubblica di Scienze (PLoS). 7 (2): e30135. doi : 10.1371/journal.pone.0030135 . ISSN  1932-6203 . PMC  3280242 . PMID  22355308 .
• Makeig, S.; Kothe, C.; Mullen, T.; Bigdely-Shamlo, N.; Kreutz-Delgado, Kenneth (2012). "Elaborazione del segnale in evoluzione per interfacce cervello-computer" . Atti dell'IEEE . Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE). 100 (numero speciale del centenario): 1567–1584. doi : 10.1109/jproc.2012.2185009 . ISSN  0018-9219 .

Cassette degli attrezzi:

• Zeynep Akalin Acar & Scott Makeig, Strumenti di modellazione della testa neuroelettromagnetica in avanti J Neurosci Meth doi:10.1016/jneumeth.2010.04.031 (2010)
• Nolan, H., Whelan, R. e Reilly, RB "FASTER: soglia statistica completamente automatizzata per il rifiuto degli artefatti EEG". Journal of Neuroscience Methods 192 (1): 152-162 (2010)
• Delorme, A., Mullen, T., Kothe, C., Bigdely-Shamlo, N., Akalin, Z., Vankov, A., Makeig, S. EEGLAB, MPT, NetSIFT, NFT, BCILAB ed ERICA: Nuovo strumenti per l'elaborazione avanzata di EEG/MEG. Intelligenza computazionale, ID articolo 130714 (2011)
• N Bigdely-Shamlo, T. Mullen, K. Kreutz-Delgado, S Makeig. Analisi della proiezione della misura: un approccio probabilistico al confronto delle sorgenti EEG e all'inferenza multi-soggetto. doi://10.1016/j.neuroimage.2013.01.040 (2013)

link esterno

• Pagina EEGLAB presso lo Swartz Center for Computational Neuroscience