APAF1 - APAF1

APAF1
Structures disponibles
APD	Recherche orthologue : PDBe RCSB
Liste des codes d'identification PDB
	1C15 , 1CWW , 1CY5 , 1Z6T , 2P1H , 2YGS , 3J2T , 3YGS , 4RHW , 3JBT
Identifiants
Alias	APAF1 , APAF-1, CED4, facteur d'activation de la peptidase apoptotique 1
Identifiants externes	OMIM : 602233 MGI : 1306796 HomoloGene : 7626 GeneCards : APAF1
Emplacement du gène ( humain )
Chr.	Chromosome 12 (humain)
Finir	98 735 433 pb
Emplacement du gène ( Souris )
Chr.	Chromosome 10 (souris)
Finir	91 082 770 pb
Modèle d' expression de l'ARN
	; ; ; ;
	Plus de données d'expression de référence
ontologie du gène
Fonction moléculaire	• liaison de la protéine de choc thermique ; • ADP liaison ; • GO: 0001948 protéine de liaison ; • protéine de liaison identique ; • liaison de l' ATP ; • nucléotidique de liaison ; • activité d'activateur du endopeptidase de type cysteine impliqués dans le processus apoptotique;
Composant cellulaire	• cytoplasme ; • cytosol ; • exosome extracellulaire ; • noyau ; • apoptosome ; • région extracellulaire ; • lumière granulaire sécrétoire ; • lumière granulaire riche en ficoline-1 ; • complexe contenant des protéines;
Processus biologique	• réponse cellulaire au stimulus bêta du facteur de croissance transformant ; • processus apoptotique des neurones ; • régulation du processus apoptotique ; • différenciation cellulaire ; • réponse à l'hypoxie ; • réponse au nutriment ; • réponse à la signalisation des points de contrôle des dommages à l'ADN G1 ; • vieillissement ; • régulation positive de la voie de signalisation apoptotique ; • apoptotique des cellules gliales processus ; • développement du système nerveux ; • le développement de l' organisme multicellulaire ; • processus apoptotique des cellules du muscle cardiaque ; • voie de signalisation intrinsèque apoptotique ; • voie de signalisation intrinsèque apoptotiques en réponse au stress du reticulum endoplasmique ; • fermeture du tube neural ; • le développement du cerveau ; • une régulation positive du processus apoptotique ; • voie de signalisation apoptotique ; • prosencéphale développement ; • régulation de la fragmentation de l'ADN apoptotique ; • homooligomérisation des protéines ; • activation de l'activité endopeptidase de type cystéine impliquée dans le processus apoptotique ; • activation de l'activité endopeptidase de type cystéine impliquée dans le processus apoptotique par le cytochrome c ; • processus apoptotique ; • dégranulation des neutrophiles ation ; • régulation négative de la transition G0 vers G1 ; • développement des reins;
	Sources : Amigo / QuickGO
Orthologues
	317
	11783
	ENSG00000120868
	ENSMUSG00000019979
	O14727
	O88879
	NM_001160 ; NM_013229 ; NM_181861 ; NM_181868 ; NM_181869
	NM_001042558 ; NM_001282947 ; NM_009684
	NP_001151 ; NP_037361 ; NP_863651 ; NP_863658 ; NP_863659
	NP_001036023 ; NP_001269876 ; NP_033814
	Wikidata
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Le facteur d'activation de la protéase apoptotique 1 , également connu sous le nom d' APAF1 , est un homologue humain du gène CED-4 de C. elegans .

Une fonction

Ce gène code pour une protéine cytoplasmique qui forme l'un des nœuds centraux du réseau de régulation de l' apoptose . Cette protéine contient (à partir du N terminal) un domaine de recrutement de caspase ( CARD ), un domaine ATPase (NB-ARC), quelques domaines hélicoïdaux courts puis plusieurs copies du domaine de répétition WD40 . Lors de la liaison du cytochrome c et du dATP , cette protéine forme un apoptosome oligomère . L'apotosome se lie et clive la protéine Procaspase-9 , libérant sa forme mature et activée. Le mécanisme précis de cette réaction est encore débattu bien que les travaux publiés par Guy Salvesen suggèrent que l'apotosome peut induire la dimérisation de la caspase-9 et l' autocatalyse ultérieure . La caspase-9 activée stimule la cascade de caspases subséquente qui engage la cellule à l'apoptose.

L'épissage alternatif donne lieu à plusieurs variantes de transcrits codant pour différentes isoformes.

Structure

APAF1 contient un domaine CARD avec un motif de clé grecque composé de six hélices, un domaine de liaison nucléotidique à repliement de Rossman, un motif hélicoïdal court et un domaine en hélice ailée.

Interactions

Il a été démontré que APAF1 interagit avec :

Les références

Liens externes

Emplacement du génome humain APAF1 et page de détails du gène APAF1 dans le navigateur de génome UCSC .
Aperçu de toutes les informations structurelles disponibles dans le PDB pour UniProt : O14727 ( Apoptotic protease-activating factor 1) au PDBe-KB .

Lectures complémentaires

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