UK Biobank - UK Biobank

Storbritanniens biobank
UK biobank logo.png
Mission statement "forbedring af forebyggelse, diagnose og behandling af en lang række alvorlige og livstruende sygdomme-herunder kræft, hjertesygdomme, slagtilfælde, diabetes, gigt, knogleskørhed, øjensygdomme, depression og demensformer."
Kommerciel? Ingen
Beliggenhed Stockport , Greater Manchester , Storbritannien
Grundlægger Rory Collins
Etableret Januar 2007 ( 2007-01 )
Internet side www .ukbiobank Ac .uk

UK Biobank er en stor langsigtet biobankundersøgelse i Det Forenede Kongerige (UK), der undersøger de respektive bidrag fra genetisk disposition og miljøeksponering (herunder ernæring, livsstil, medicin osv.) Til udvikling af sygdom. Det begyndte i 2006.

Med base i Stockport , Greater Manchester , er det inkorporeret som et aktieselskab og registreret velgørende formål i England og Wales og registreret som en velgørende organisation i Skotland .

Design

Undersøgelsen følger omkring 500.000 frivillige i Storbritannien, indskrevet i alderen 40 til 69 år. Indledende tilmelding fandt sted over fire år fra 2006, og de frivillige vil blive fulgt i mindst 30 år derefter.

Potentielle deltagere blev inviteret til at besøge et vurderingscenter, hvor de udfyldte et automatiseret spørgeskema og blev interviewet om livsstil, sygehistorie og ernæringsvaner; grundlæggende variabler, såsom vægt, højde, blodtryk osv. blev målt; og der blev taget blod- og urinprøver . Disse prøver blev bevaret, så det var muligt senere at ekstrahere DNA og måle andre biologisk vigtige stoffer. Under hele undersøgelsens varighed var det meningen, at alle sygdomsbegivenheder, lægemiddelrecepter og dødsfald for deltagerne skulle registreres i en database, idet de udnyttede den centraliserede britiske nationale sundhedstjeneste .

Under den indledende fysisk undersøgelse, var grundlæggende feedback til deltageren med hensyn til deres vægt, højde, BMI, blodtryk , lunge vital kapacitet , knogledensitet og intraokulært tryk ; men hvis der blev opdaget andre medicinske problemer, ville hverken deltageren eller deres læge blive underrettet. Problemer, der blev opdaget senere, såsom genetiske risikofaktorer, blev ikke formidlet til hverken deltager eller læge ("for at sikre, at frivillige ikke straffes for eksempel af forsikringsselskaber, hvilket kan kræve, at kunderne oplyser resultaterne af genetiske tests.").

Fra 2012 kunne forskere ansøge om at bruge databasen (selvom de ikke får adgang til de frivillige, som vil forblive strengt anonyme). En typisk undersøgelse ved hjælp af databasen kan sammenligne en prøve af deltagere, der udviklede en bestemt sygdom , såsom kræft , hjertesygdomme , diabetes eller Alzheimers sygdom , med en prøve af dem, der ikke gjorde det, i et forsøg på at måle fordele, risikobidrag og interaktion mellem bestemte gener , livsstil og medicin.

I 2017 kunne forskere få adgang til databasen, herunder genetisk information. I 2017 havde Biobank -deltagerne cirka 1,3 millioner indlæggelser, 40.000 kræfthændelser, hvoraf 14.000 var døde.

Udvikling

Der blev vedtaget en trinvis tilgang til at udvikle undersøgelsesprocedurerne og teknologien ved hjælp af systemer designet og udviklet af Clinical Trial Service Unit . Dette bestod af en række pilotundersøgelser af stigende kompleksitet og raffinement med mellemspil til vurdering af resultater og yderligere videnskabeligt input. Interne forsøg blev gennemført i løbet af 2005, og en fuldt integreret klinik blev kørt i Altrincham , Greater Manchester i løbet af foråret 2006, hvor 3.800 personer blev vurderet. Den 22. august 2006 blev det annonceret, at hovedprogrammet ville rekruttere mænd og kvinder i alderen 40 til 69 år baseret på op til 35 regionale centre, men rekruttering viste sig at være mere effektiv end håbet, og kun 22 centre var blevet åbnet, da rekrutteringsmålet for 500.000 blev nået i 2010.

Indledende oplysninger indsamlet

Undersøgelsen blev oprindeligt lanceret med et besøg bestående af følgende:

Når den besøgsbaserede vurderingsmetode var bevist, blev omfanget af undersøgelser udvidet til at omfatte:

Etik og regeringsførelse

Det britiske Biobank -projekt fungerer inden for rammerne af et ramme for etik og styring. Rammen beskriver en række standarder, som UK Biobank vil operere efter under oprettelsen, vedligeholdelsen og brugen af ​​ressourcen, og den uddyber de forpligtelser, der er involveret over for dem, der deltager i projektet, forskere og offentligheden i bredere forstand. Det uafhængige UK Biobank Ethics and Governance Council giver råd til projektet og overvåger dets overensstemmelse med rammen. Rådet rådgiver også mere generelt om forskningsdeltageres og offentlighedens interesser i relation til projektet.

UK Biobank Board er ansvarlig over for selskabets medlemmer ( Medical Research Council og The Wellcome Trust ) og fungerer som selskabsdirektører og som velgørende forvaltere. Det ledes af Lord Kakkar , der efterfulgte Sir Michael Rawlins i januar 2020.

Rekruttering

Efter den første pilotfase i perioden 2005-6 begyndte hovedundersøgelsen i april 2007, og ved udgangen af ​​det år havde 50.000 mennesker deltaget. Rekruttering nåede 100.000 i april 2008, 200.000 i oktober 2008, 300.000 i maj 2009, 400.000 i november 2009 og passerede 500.000 -målet i juli 2010. Deltagerindskrivning blev erklæret afsluttet i august 2010. De frivillige var stort set raske, velhavende og hvide europæere. I stedet for at rekruttere flere deltagere til biobanken hjælper organisationen andre institutioner med at etablere og køre lignende initiativer.

Anvendelse

Det britiske Biobank -datasæt blev åbnet for ansøgninger fra forskere i marts 2012. Ressourcen er tilgængelig for forskere fra Storbritannien og uden for, uanset om de arbejder i den offentlige eller private sektor, til industri, akademi eller velgørende formål, med forbehold af verifikation af, at forskningen er sundhedsrelateret og i almen interesse. Forskere skal offentliggøre deres resultater på et open source -publikationssted eller i et akademisk tidsskrift og returnere deres resultater til den britiske biobank. I april 2017 havde 4.600 forskere registreret sig til at bruge ressourcen, over 880 ansøgninger var blevet indsendt, og 430 forskningsprojekter blev afsluttet eller i gang. 130 peer-reviewed artikler baseret på britiske biobankdata var blevet offentliggjort i januar 2017.

Udvidelser

Siden rekrutteringens afslutning er der tilføjet flere nye typer data:

  • I løbet af 2011-12 blev deltagerne, der angav en e-mail-adresse, bedt om at hjælpe med at udfylde webbaserede kostundersøgelser med det formål at kombinere en række daglige 'snapshots' for at danne et billede af den samlede ernæring. 176.012 af deltagerne svarede mindst én gang, og 27.535 besvarede fire spørgeskemaer over en periode på 16 måneder.
  • I løbet af 2012-13 blev 25.000 deltagere på Stockport-centret bedt om at deltage i vurderingscentret for at gentage de første målinger. Det var hensigten at gentage disse vurderinger hvert par år.
  • I 2013 til 2015 blev Axivity AX3 tri-aksial håndleds fysisk aktivitetsmonitorer distribueret til 100.000 deltagere, der registrerede ugelang triaksial acceleration ved 100 Hz. Disse data blev centralt behandlet og opført på Data Showcase.
  • I 2014 og 2015 besvarede 120.000 deltagere et spørgeskema om kognitive funktioner. Fire af testene var gentagelser af den indledende vurdering, og to tests (substitution af symbolcifre og spordannelse) var nye.
  • I 2015 og 2016 besvarede 117.500 deltagere spørgeskemaer om erhvervshistorie og tilhørende medicinsk information.
  • I 2016 og 2017 besvarede 137.400 deltagere spørgeskemaer om psykiske begivenheder, herunder subjektive trivselsestimater, psykotiske oplevelser, selvskadende adfærd, traumatiske hændelser og hash- og alkoholbrug.
  • Et genomisk assay på 820.967 SNP'er blev udført på deltagernes blodprøver. Data fra de første 150.000 deltagere blev frigivet i 2015, resten i juli 2017 og de første resultater i oktober 2018.
  • Oplysninger fra britiske registre over død (fra 2006) og kræft (Skotland fra 1957, England og Wales fra 1995) blev løbende knyttet til det vigtigste Biobank -datasæt.
  • Data fra NHS -hospitals indlagte poster (England fra 1996, Skotland fra 1997 og Wales fra 1998) blev løbende knyttet til hoveddatasættet.
  • I 2019 blev exome sekvensdata fra 50.000 personer frigivet, med 200.000 tilgængelige i 2020.
  • I 2020 blev 20.000 frivillige enige om at indsamle og sende en månedlig blodprøve til analyse af SARS-CoV-2- antistoffer. De omfattede eksisterende Biobank -deltagere og deres børn og voksne børnebørn, der bor i separate husstande.
  • I 2021 blev NMR metabolomiske data om 125.000 personer frigivet.
  • I juni 2021 blev en delmængde af frivillige, der havde erkendt, at de allerede havde modtaget mindst den første Covid-19-podningsdosis, blevet bedt om at deltage i en undersøgelse for at afgøre, om deres Covid-19-antistoffer var et resultat af deres podning eller fra en tidligere infektion.

Løbende udviklinger

I 2018 var en række projekter i gang for at generere yderligere data:

  • Et sæt yderligere assays på blod- og urinprøver blev udført i 2016 og 2017 med blodresultater, der forventes frigivet i 4. kvartal 2018.
  • En ny type vurderingscenter åbnede i 2014 for at indsamle billeddata. Besøgene udvidede det indledende datasæt til at omfatte magnetisk resonansbilledskanning ( MRI ) scanning af hjernehjerte og mave samt nakke-til-knæ volumetriske MR-scanninger, dual body-røntgenabsorptiometri ( DXA ) af hele kroppen af knogler og led , ultralydsmålinger af halspulsårerne og hvilende 12-afledt elektrokardiogram ( EKG ). Indledende data om 4.000 deltagere blev frigivet i slutningen af ​​2015, og medio 2018 var over 25.000 deltagere blevet scannet. Det er planlagt at scanne 100.000 deltagere inden 2022 og foretage yderligere gentagelsesscanninger på 10.000 af disse 2-3 år senere.
  • En delmængde på 2500 deltagere bliver bedt om at gentage aktivitetsundersøgelsen med kvartalsvise mellemrum i et år for at måle størrelsen på sæsoneffekter.

Fremtidsplaner

I 2018 var der flere planer, enten foreløbige eller i gang, for at forbedre ressourcen:

  • Primærplejedata (såsom henvisninger, diagnoser og recepter) var planlagt til at blive gjort tilgængelige i 2018–2019.
  • Sammenkædning af data fra NHS hospitals ambulante journaler og praktiserende læge til hovedsættet blev undersøgt i 2018.
  • Koblinger til sygdomsspecifikke registre og screeningsprogrammer blev også undersøgt i 2018.
  • Exome-sekventering er i gang med den første batch på 50.000 sekvenser, der skal frigives i midten af ​​2019.
  • Fuld genom sekvensering blev undersøgt med et pilotprojekt i gang.

Mening

Projektet er generelt blevet rost for sit ambitiøse omfang og unikke potentiale. Et videnskabeligt evalueringspanel konkluderede, at "UK Biobank har potentiale på måder, der i øjeblikket ikke er tilgængelige andre steder, til at understøtte en bred vifte af forskning". Colin Blakemore , administrerende direktør for MRC , forudsagde, at det "vil give forskere ekstraordinær information" og "vokse til en unik ressource for fremtidige generationer."

Der kom dog noget tidlig kritik. GeneWatch UK, en pressionsgruppe , der hævder at fremme ansvarlig brug af genetisk information, hævdede, at kompleksiteten af programmet kan resultere i konstateringen af "falske forbindelser mellem gener og sygdom", og udtrykte bekymring for, at den genetiske information fra patienter kunne være patenteret til kommercielle formål. Biobanks administrerende direktør beskrev en sådan risiko som "ekstremt lav, hvis den overhovedet eksisterer."

Metoden til at rekruttere deltagere var også oprindeligt kontroversiel. Deltagerne fik tilsendt invitationsbreve baseret på navne, adresser og fødselsdatoer fra NHS til de britiske biobankarrangører. Selvom de var i overensstemmelse med britisk databeskyttelseslov, protesterede nogle mennesker mod, at NHS videregav sådanne data til tredjeparter uden udtrykkeligt samtykke og havde også bekymringer om datasikkerheden i et så stort projekt.

Nogle litteratur har givet anledning til bekymring for, at den britiske biobank ikke er repræsentativ for mangfoldigheden i den britiske befolkning eller ikke kan anvendes på forskellige befolkningsgrupper.

Finansiering

Den britiske biobank finansieres af det britiske sundhedsministerium , det medicinske forskningsråd, den skotske direktør og Wellcome Trusts medicinske forskningsorganisationer. Omkostningerne ved den første deltagerrekruttering og vurderingsfase var 62 millioner GBP .

Relaterede projekter

EPIC (European Prospective Investigation in Cancer and Nutrition) er en lignende undersøgelse, der blev startet i 1992 og involverer 520.000 mænd og kvinder, hovedsageligt mellem 35 og 70 år gamle fra ti europæiske lande. Deltagerne kontaktes igen hvert tredje til femte år. Det er specielt designet til at studere de respektive roller af diæt og gener i udviklingen af ​​kræft.

I 1996 grundlagde den islandske neurolog Kári Stefánsson et privat firma deCODE genetics til at samle genealogiske, genomiske og sundhedsmæssige data fra hele Islands befolkning - derefter omkring 270.000 mennesker. Formålet var at udvinde disse data under krypterede identifikatorer genereret af landets databeskyttelsesmyndighed, til at identificere genetiske variationer forbundet med sygdomme og bruge disse oplysninger til at udvikle nye lægemidler. Fra 2018 havde mere end 160.000 mennesker bidraget med DNA og detaljerede sundhedsoplysninger til virksomhedens forskning i de nedarvede komponenter i almindelige og sjældne sygdomme. deCODE har offentliggjort hundredvis af opdagelser inden for hjerte -kar -og autoimmune sygdomme, Alzheimers og andre sygdomme i centralnervesystemet, mange former for kræft og snesevis af andre tilstande og træk. DeCODE er nu et uafhængigt datterselskab af Amgen og har givet nye mål nu inden for klinisk udvikling og giver validering af menneskelig genetik på tværs af en række terapeutiske områder. I 2018 gav Stefansson afkald på et løfte om, at virksomheden ville lancere et websted, der gør det muligt for islændinge at anmode om analyse af deres sekvensdata for at afgøre, om de bærer en SNP i BRCA2 -genet, der er forbundet med islændinge til en væsentligt øget risiko for bryst og prostatakræft. Mere end 10% af befolkningen har brugt denne portal, og landets nationale sundhedssystem har øget klinisk testning, rådgivning og behandling for at drage fordel af disse oplysninger til folkesundhed.

Det estiske genomprojekt blev startet i 2000 med det formål at forbedre folkesundheden i landet. Oprindeligt var det håbet at få biologiske prøver og sundhedsdata fra 70% af den 1,4 millioner befolkning i Estland. Projektets mål blev imidlertid reduceret med årene. Ved udgangen af ​​2019 havde Estonian Genome Project rekrutteret 200 000 gendonorer, dvs. 20% af den voksne befolkning.

Den Kina Kadoorie Biobank undersøgelse indsamlede spørgeskema og fysiske data og blodprøver på 510.000 mænd og kvinder i alderen mellem 30 og 79 fra 10 regioner i Kina mellem 2004-2008 med det formål at undersøge kroniske sygdomme (f.eks hjerteanfald, slagtilfælde, diabetes og kræft ). Deltagerne er blevet knyttet til dødelighedsregistre og landsdækkende sundhedssystemer, og en undergruppe på 25.000 testes igen hvert par år.

I 2006 blev et lignende projekt foreslået af US National Human Genome Research Institute kendt som "The American project". I 2015 lancerede US National Institutes of Health " Precision Medicine Initiative ", der blev omdøbt til "All of Us" i 2016. Dette projekt havde tilmeldt over 10.000 mennesker inden januar 2018 i en pilotfase med det formål at tilmelde en million deltagere inden 2022. Fra februar 2021 har programmet registreret 369.000 deltagere med 235.000 elektroniske sundhedsjournaler og 280.000 bioprøver.

Lifelines -kohorteundersøgelsen blev startet i 2006 og indsamler data og prøver på 167.000 børn, voksne og ældre fra den nordlige del af Holland . Målet med Lifelines er at udgøre en biobank, der leverer data og prøver af høj kvalitet ved at følge alle deltagere over en periode på mindst 30 år. De indsamlede data giver fremragende muligheder for undersøgelser verden over, der opklarer ætiologien for multifaktorielle sygdomme med fokus på multifaktor -risikofaktorer. Dette vil hjælpe med at gå videre til mere personlig sundhedspleje og forebyggelse og besvare spørgsmålet om, hvorfor nogle mennesker bliver gamle ved et godt helbred, mens andre får sygdomme.

Den Finngen -projektet blev lanceret i 2018 med det formål at indsamle biologiske prøver fra 500.000 deltagere i Finland over seks år med det formål at forbedre sundheden gennem genetisk forskning.

East London Genes & Health er en genomisk undersøgelse af 100.000 mennesker af bangladeshisk og pakistansk oprindelse udført af Queen Mary University of London .

Se også

Referencer

eksterne links