POLQ - POLQ
DNA polymeráza theta je enzym , který u lidí je kódován POLQ genem . Tato polymeráza hraje klíčovou roli v jedné ze tří hlavních opravných drah zlomení dvouřetězců: theta zprostředkované spojování konců (TMEJ). Většina dvouvláknových zlomů se opravuje nehomologním spojováním konců (NHEJ) nebo homologně řízenou opravou (HDR). V některých kontextech jsou však NHEJ a HR nedostatečné a TMEJ je jediným řešením, jak přestávku opravit. TMEJ je často popisován jako alternativní NHEJ, ale liší se tím, že postrádá požadavek na heterodimer Ku a může působit pouze na konce resekované DNA. Po žíhání krátkých (tj. Několika nukleotidových) oblastí na přesahech DNA katalyzuje DNA polymeráza theta syntézu DNA závislou na templátu přes poškozené konce a stabilizuje spárovanou strukturu.
Mutační podpis polymerázy theta
TMEJ je skutečně mutagenní , protože polymeráza theta používá k zahájení opravy homologní nukleotidy z obou konců zlomení, což vede ke ztrátě jedné sady těchto nukleotidů v sekvenci DNA. Proto je TMEJ formou mikrohomologie zprostředkovaného spojování konců (MMEJ). Navíc, pokud nejsou zlomené konce správně stabilizovány, mohou se zlomené konce po polymeraci oddělit. Když tyto polymerované konce znovu žíhají, mezi delečními spoji vznikne šablonovaná vložka .
Reverzní transkripce RNA
Polθ = podporuje opravu DNA templátovanou DNA . Dříve se předpokládalo, že DNA polymerázy pouze přepisují DNA na DNA nebo RNA a nejsou schopny zapisovat segmenty RNA do DNA .
Reference
Další čtení
- Hogg M, Sauer-Eriksson AE, Johansson E (březen 2012). "Promiskuitní syntéza DNA lidskou DNA polymerázou θ" . Výzkum nukleových kyselin . 40 (6): 2611–22. doi : 10,1093 / nar / gkr1102 . PMC 3315306 . PMID 22135286 .
- Robertson NG, Khetarpal U, Gutiérrez-Espeleta GA, Bieber FR, Morton CC (září 1994). „Izolace nových a známých genů z lidské kochleární cDNA knihovny plodu pomocí subtraktivní hybridizace a diferenciálního screeningu“. Genomika . 23 (1): 42–50. doi : 10,1006 / geno.1994.1457 . PMID 7829101 .
- Maga G, Shevelev I, Ramadan K, Spadari S, Hübscher U (květen 2002). „DNA polymeráza theta purifikovaná z lidských buněk je vysoce věrný enzym“. Journal of Molecular Biology . 319 (2): 359–69. doi : 10.1016 / S0022-2836 (02) 00325-X . PMID 12051913 .
- Seki M, Marini F, Wood RD (listopad 2003). „POLQ (Pol theta), DNA polymeráza a DNA závislá ATPáza v lidských buňkách“ . Výzkum nukleových kyselin . 31 (21): 6117–26. doi : 10,1093 / nar / gkg814 . PMC 275456 . PMID 14576298 .
- Kawamura K, Bahar R, Seimiya M, Chiyo M, Wada A, Okada S a kol. (Březen 2004). „DNA polymeráza theta je přednostně exprimována v lymfoidních tkáních a upregulována u lidských rakovin“ . International Journal of Cancer . 109 (1): 9–16. doi : 10,1002 / ijc.11666 . PMID 14735462 . S2CID 19912440 .
- Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M, Sakakibara Y, Chiba J, Mizushima-Sugano J a kol. (Září 2004). "Porovnání sekvencí lidských a myších genů odhaluje homologní blokovou strukturu v promotorových oblastech" . Výzkum genomu . 14 (9): 1711–8. doi : 10,1101 / gr . 2435604 . PMC 515316 . PMID 15342556 .
- Seki M, Masutani C, Yang LW, Schuffert A, Iwai S, Bahar I, Wood RD (listopad 2004). „Vysoce účinný obtok poškození DNA lidskou DNA polymerázou Q“ . Časopis EMBO . 23 (22): 4484–94. doi : 10,1038 / sj.emboj.7600424 . PMC 526458 . PMID 15496986 .
- Chiapperino D, Cai M, Sayer JM, Yagi H, Kroth H, Masutani C a kol. (Prosinec 2005). „Syntéza syntézy náchylná k chybám lidskou DNA polymerázou eta na deoxyadenosinových aduktech obsahujících DNA 7,8-dihydroxy-9,10-epoxy-7,8,9,10-tetrahydrobenzo [a] pyrenu“ . The Journal of Biological Chemistry . 280 (48): 39684–92. doi : 10,1074 / jbc.M508008200 . PMID 16188888 .
- Zan H, Shima N, Xu Z, Al-Qahtani A, Evinger Iii AJ, Zhong Y a kol. (Listopad 2005). „Translesionová DNA polymeráza theta hraje dominantní roli v somatické hypermutaci genu imunoglobulinu“ . Časopis EMBO . 24 (21): 3757–69. doi : 10,1038 / sj.emboj.7600833 . PMC 1276717 . PMID 16222339 .
- Cruet-Hennequart S, Coyne S, Glynn MT, Oakley GG, Carty MP (duben 2006). „UV-indukovaná RPA fosforylace se zvyšuje v nepřítomnosti DNA polymerázy eta a vyžaduje DNA-PK“. Oprava DNA . 5 (4): 491–504. doi : 10.1016 / j.dnarep.2006.01.008 . PMID 16520097 .
- Chen YW, Cleaver JE, Hanaoka F, Chang CF, Chou KM (duben 2006). "Nová role DNA polymerázy eta při modulaci buněčné citlivosti na chemoterapeutická činidla" . Výzkum molekulární rakoviny . 4 (4): 257–65. doi : 10.1158 / 1541-7786.MCR-05-0118 . PMID 16603639 .
- Yuasa MS, Masutani C, Hirano A, Cohn MA, Yamaizumi M, Nakatani Y, Hanaoka F (červenec 2006). „Komplex lidské DNA polymerázy eta obsahující Rad18, Rad6 a Rev1; proteomická analýza a cílení komplexu na frakci buněk vázaných na chromatin zadržovaných replikační vidlicí“ . Geny do buněk . 11 (7): 731–44. doi : 10.1111 / j.1365-2443.2006.00974.x . PMID 16824193 . S2CID 32695133 .
- Choi JY, Stover JS, Angel KC, Chowdhury G, Rizzo CJ, Guengerich FP (září 2006). „Biochemický základ genotoxicity heterocyklických arylaminových potravinových mutagenů: Lidská DNA polymeráza eta selektivně produkuje deleci dvou bází při kopírování N2-guanylového aduktu 2-amino-3-methylimidazo [4,5-f] chinolinu, ale ne C8 aduktu na webu NarI G3 " . The Journal of Biological Chemistry . 281 (35): 25297–306. doi : 10,1074 / jbc.M605699200 . PMID 16835218 .
- Kino K, Ito N, Sugasawa K, Sugiyama H, Hanaoka F (2007). „Syntéza translese lidskou DNA polymerázou eta napříč oxidačními produkty guaninu“ . Série sympozií o nukleových kyselinách . 48 (48): 171–2. doi : 10,1093 / nass / 48.1.171 . PMID 17150533 .
- Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S a kol. (2007). "Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií" . Molekulární biologie systémů . 3 (1): 89. doi : 10,1038 / msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .