FANCF - FANCF
Fanconiho anémie skupiny F protein je protein, který u lidí je kódován FANCF genem .
Interakce
Bylo prokázáno, že FANCF interaguje s Fanconiho anémií, komplementární skupinou C , FANCG , FANCA a FANCE .
Funkce
FANCF je adaptorový protein, který hraje klíčovou roli ve správném sestavení komplexu FA jádra. Komplex FA jádra se skládá z osmi proteinů (FANCA, -B, -C, -E, -F, -G, -L a -M). FANCF stabilizuje interakci mezi subkomplexem FANCC/FANCE a subkomplexem FANCA/FANCG a uzamkne celý komplex jádra FA v konformaci, která je nezbytná pro plnění jeho funkce při opravě DNA.
Komplex jádra FA je komplex jaderného jádra, který je nezbytný pro monoubiquitinaci FANCD2 a tato modifikovaná forma FANCD2 kolokalizuje s BRCA1, RAD51 a PCNA v ohniscích, která také obsahují další proteiny opravy DNA. Všechny tyto proteiny fungují společně a usnadňují opravu meziřetězcové DNA. Fungují také v jiných opravných procesech odezvy na poškození DNA, včetně obnovy a stabilizace zablokovaných replikačních vidlic. Protein FoxF1 také interaguje s jádrem FA proteinu a indukuje jeho vazbu na chromatin za účelem podpory opravy DNA.
Rakovina
Poškození DNA se zdá být primární základní příčinou rakoviny a nedostatky v expresi genů pro opravu DNA se zdají být základem mnoha forem rakoviny. Pokud je oprava DNA nedostatečná, poškození DNA se obvykle hromadí. Takovéto nadměrné poškození DNA může zvýšit mutace v důsledku syntézy transleze náchylné k chybám . Nadměrné poškození DNA může také zvýšit epigenetické změny způsobené chybami během opravy DNA. Takové mutace a epigenetické změny mohou vést k rakovině .
Snížení exprese genů pro opravu DNA (obvykle způsobené epigenetickými změnami) je u rakovin velmi časté a nejčastěji je mnohem častější než mutační defekty genů pro opravu DNA u rakovin. (Viz také Frekvence epimutací v genech pro opravu DNA .)
Metylace promotorové oblasti genu FANCF způsobuje sníženou expresi proteinu FANCF.
V tabulce jsou uvedeny četnosti methylace promotoru FANCF u několika různých druhů rakoviny.
| Rakovina | Frekvence | Ref. |
|---|---|---|
| Epiteliální rakovina vaječníků | 32% | |
| Cervikální karcinom | 30% | |
| Rakovina vaječníků | 21%-28% | |
| Skvamózní karcinomy hlavy a krku | 15% | |
| Nemalobuněčný karcinom plic | 14% | |
| Nádor mužských zárodečných buněk | 6% |
U invazivních rakovin prsu byla zvýšena mikroRNA -210 (miR-210) spolu se sníženou expresí FANCF, kde FANCF byl jedním z pravděpodobných cílů miR-210.
Ačkoli mutace ve FANCF nejsou u lidských nádorů obvykle pozorovány, myší model s deficitem FANCF byl náchylný k rakovině vaječníků.
FANCF se zdá být jedním z asi 26 genů pro opravu DNA, které jsou epigeneticky potlačovány při různých rakovinách (viz Epigenetika rakoviny ).
Neplodnost
K gonády z FANCF mutantní funkce myší abnormálně, že ohrožena folikulů rozvoj a spermatogenezi , jak bylo pozorováno u jiných Fanconiho anémie myších modelech a v Fanconiho anémie u pacientů. Histologické vyšetření varlat z FANCF-deficientních myší ukázaly, že semenotvorné kanálky byly bez zárodečných buněk . Ve věku 14 týdnů byly samice myší s nedostatkem FANCF téměř nebo úplně bez prvotních folikulů . Byl učiněn závěr, že myši s deficitem FANCF vykazují v mladém věku rychlé vyčerpání prvotních folikulů, což vede k pokročilému stárnutí vaječníků .
Reference
Další čtení
- Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení cap struktury eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen . 138 (1–2): 171–4. doi : 10,1016/0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). „Konstrukce a charakterizace cDNA knihovny obohacené o celou délku a 5'-konce obohacené“. Gen . 200 (1–2): 149–56. doi : 10,1016/S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
- de Winter JP, Rooimans MA, van Der Weel L, van Berkel CG, Alon N, Bosnoyan-Collins L, de Groot J, Zhi Y, Waisfisz Q, Pronk JC, Arwert F, Mathew CG, Scheper RJ, Hoatlin ME, Buchwald M, Joenje H (leden 2000). „Gen Fanconiho anémie FANCF kóduje nový protein s homologií s ROM“. Přírodní genetika . 24 (1): 15–6. doi : 10,1038/71626 . PMID 10615118 . S2CID 26394122 .
- de Winter JP, van der Weel L, de Groot J, Stone S, Waisfisz Q, Arwert F, Scheper RJ, Kruyt FA, Hoatlin ME, Joenje H (listopad 2000). „Fanconiho anemický protein FANCF tvoří jaderný komplex s FANCA, FANCC a FANCG“ . Lidská molekulární genetika . 9 (18): 2665–74. doi : 10,1093/hmg/9,18,2665 . PMID 11063725 .
- Medhurst AL, Huber PA, Waisfisz Q, de Winter JP, Mathew CG (únor 2001). „Přímé interakce pěti známých proteinů Fanconiho anémie naznačují společnou funkční cestu“ . Lidská molekulární genetika . 10 (4): 423–9. doi : 10,1093/hmg/10,4,423 . PMID 11157805 .
- Pace P, Johnson M, Tan WM, Mosedale G, Sng C, Hoatlin M, de Winter J, Joenje H, Gergely F, Patel KJ (červenec 2002). „FANCE: spojení mezi sestavením komplexu Fanconiho anémie a aktivitou“ . EMBO Journal . 21 (13): 3414–23. doi : 10,1093/emboj/cdf355 . PMC 125396 . PMID 12093742 .
- Taniguchi T, D'Andrea AD (říjen 2002). „Protein Fanconiho anémie, FANCE, podporuje jadernou akumulaci FANCC“ . Krev . 100 (7): 2457–62. doi : 10,1182/krev-2002-03-0860 . PMID 12239156 .
- Gordon SM, Buchwald M (červenec 2003). „Komplex proteinů Fanconiho anemie: mapování interakcí proteinů v kvasinkových 2- a 3-hybridních systémech“. Krev . 102 (1): 136–41. doi : 10,1182/krev-2002-11-3517 . PMID 12649160 .
- Meetei AR, Sechi S, Wallisch M, Yang D, Young MK, Joenje H, Hoatlin ME, Wang W (květen 2003). „Multiproteinový jaderný komplex spojuje Fanconiho anémii a Bloomův syndrom“ . Molekulární a buněčná biologie . 23 (10): 3417–26. doi : 10.1128/MCB.23.10.3417-3426.2003 . PMC 164758 . PMID 12724401 .
- Meetei AR, de Winter JP, Medhurst AL, Wallisch M, Waisfisz Q, van de Vrugt HJ, Oostra AB, Yan Z, Ling C, Bishop CE, Hoatlin ME, Joenje H, Wang W (říjen 2003). „Nová ubikvitinová ligáza má nedostatek Fanconiho anémie“. Přírodní genetika . 35 (2): 165–70. doi : 10,1038/ng1241 . PMID 12973351 . S2CID 10149290 .
- Marsit CJ, Liu M, Nelson HH, Posner M, Suzuki M, Kelsey KT (leden 2004). „Inaktivace dráhy Fanconiho anémie/BRCA u rakoviny plic a ústní dutiny: důsledky pro léčbu a přežití“ . Onkogen . 23 (4): 1000–4. doi : 10,1038/sj.onc.1207256 . PMID 14647419 .
- Tsutsumi S, Kamata N, Vokes TJ, Maruoka Y, Nakakuki K, Enomoto S, Omura K, Amagasa T, Nagayama M, Saito-Ohara F, Inazawa J, Moritani M, Yamaoka T, Inoue H, Itakura M (červen 2004) . „Nový gen kódující domnělý transmembránový protein je mutován v gnathodiafyzální dysplázii (GDD)“ . American Journal of Human Genetics . 74 (6): 1255–61. doi : 10,1086/421527 . PMC 1182089 . PMID 15124103 .
- Narayan G, Arias-Pulido H, Nandula SV, Basso K, Sugirtharaj DD, Vargas H, Mansukhani M, Villella J, Meyer L, Schneider A, Gissmann L, Dürst M, Pothuri B, Murty VV (květen 2004). „Hypermethylace promotoru FANCF: narušení dráhy Fanconiho anémie-BRCA u rakoviny děložního čípku“ . Výzkum rakoviny . 64 (9): 2994–7. doi : 10,1158/0008-5472.CAN-04-0245 . PMID 15126331 .
- Léveillé F, Blom E, Medhurst AL, Bier P, Laghmani el H, Johnson M, Rooimans MA, Sobeck A, Waisfisz Q, Arwert F, Patel KJ, Hoatlin ME, Joenje H, de Winter JP (září 2004). „Produkt Fanconiho anemického genu FANCF je flexibilní adaptorový protein“ . The Journal of Biological Chemistry . 279 (38): 39421–30. doi : 10,1074/jbc.M407034200 . PMID 15262960 .
- Meetei AR, Levitus M, Xue Y, Medhurst AL, Zwaan M, Ling C, Rooimans MA, Bier P, Hoatlin M, Pals G, de Winter JP, Wang W, Joenje H (listopad 2004). „X-vázaná dědičnost Fanconiho anémie komplementární skupiny B“ . Přírodní genetika . 36 (11): 1219–24. doi : 10,1038/ng1458 . PMID 15502827 .
- Meetei AR, Medhurst AL, Ling C, Xue Y, Singh TR, Bier P, Steltenpool J, Stone S, Dokal I, Mathew CG, Hoatlin M, Joenje H, de Winter JP, Wang W (září 2005). „Lidský ortolog archaealního DNA opravného proteinu Hef je defektní ve skupině M komplementární Fanconiho anémie“ . Přírodní genetika . 37 (9): 958–63. doi : 10,1038/ng1626 . PMC 2704909 . PMID 16116422 .
