LAMP1 - LAMP1

LAMP1
Identifikátory
Přezdívky	LAMP1 , CD107a, LAMPA, LGP120, lysozomálně asociovaný membránový protein 1
Externí ID	OMIM : 153330 MGI : 96745 HomoloGene : 4061 Genové karty : LAMP1
Umístění genu ( člověk )
Chr.	Chromozom 13 (člověk)
Konec	113,323,672 bp
Umístění genu ( myš )
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	13 175 338 bp
Vzorec pro expresi RNA
	; ; ; ;
	Více referenčních výrazů
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba specifická pro proteinovou doménu ; • aktivita receptoru viru ; • GO: 0001948 vazba na protein ; • vazba enzymu;
Buněčná složka	• integrální složka membrány ; • multivesikulární těleso ; • fagolysozomální membrána ; • váček ; • endosom ; • pozdní endozom ; • membrána ; • synaptický váček ; • cytolytický granulát ; • melanosom ; • integrální součást plazmatické membrány ; • alveolární lamelové tělo ; • povrch buňky ; • lysozomální membrána ; • tělo neuronů ; • vakuola ; • dendrit ; • fagocytární váček ; • perinukleární oblast cytoplasma ; • sarkolemou ; • lysosom ; • endozom membrána ; • extracelulární Exosom ; • GO: 0016023 cytoplazmatická váček ; • vnější straně plazmatické membrány ; • cytosol ; • cytoplasma ; • plazmatická membrána ; • azurofilnich granule membrána ; • autolysosome ; • ficolin-1- bohatá granulovaná membrána ; • integrální součást synaptické vesikulární membrány ; • pozdní endozomální membrána;
Biologický proces	• stabilizace proteinu ; • transport Golgiho do lyzozomu ; • pozitivní regulace degranulace přirozených zabijáckých buněk ; • regulace transportu organel podél mikrotubulů ; • vstup viru do hostitelské buňky ; • GO: 0022415 virový proces ; • stanovení lokalizace proteinů do organel ; • pozitivní regulace zprostředkovaná přirozenými zabijáckými buňkami cytotoxicita ; • apoptotická signální dráha zprostředkovaná granzymem ; • autofagická buněčná smrt ; • degranulace neutrofilů;
	Zdroje: Amigo / QuickGO
Ortology
	3916
	16783
	ENSG00000185896
	ENSMUSG00000031447
	P11279
	P11438
	NM_005561
	NM_010684 ; NM_001317353
	NP_005552
	NP_001304282 ; NP_034814
	Wikidata
Zobrazit/upravit člověka	Zobrazit/upravit myš

Lysozomální související s membránový protein 1 ( LAMP1 ), také známý jako lysozomy spojené membránový glykoprotein 1 a CD107a ( C lesk D ifferentiation 107a), je protein, který u lidí je kódován LAMP1 genem . Lidský gen LAMP1 je umístěn na dlouhém rameni (q) chromozomu 13 v oblasti 3, pásmu 4 (13q34).

Imunofluorescenční barvení buněk HeLa protilátkou k odhalení lysozomálního LAMP1 v červené barvě a intermediárních vláken obsahujících vimentin v zelené barvě. Jaderná DNA je vidět modře. Protilátky a obrázek laskavým EnCor Biotechnology Inc .

Lysozomálně asociovaný membránový protein 1 je glykoprotein z rodiny membránových glykoproteinů spojených s lysozomem . Glykoprotein LAMP-1 je transmembránový protein typu I, který je exprimován ve vysokých nebo středních hladinách v alespoň 76 různých normálních typech tkáňových buněk. Je umístěn primárně přes ysozomální membrány a funguje tak, že poskytuje selektiny se sacharidovými ligandy . Ukázalo se také, že CD107a je marker degranulace na lymfocytech, jako jsou buňky CD8+ a NK . a může také hrát roli v diferenciaci nádorových buněk a metastázách .

Struktura

Tyto glykoproteiny, které leží primárně přes lysozomální membrány, se skládají z velkého, vysoce glykosylovaného konce s uhlíkovými řetězci spojenými s N na luminální straně membrány a krátkého C-koncového ocasu vystaveného cytoplazmě . Extracytoplasmic oblast obsahuje pant-strukturu, která může tvořit disulfidové můstky homologní k, které byly pozorovány v lidském imunoglobulinu A . Mezi další charakteristiky struktury glykoproteinů LAMP-1 patří:

Polypeptid jádro ~ 40 kDa
18 stránek { N-glykosylace }, které pomohou s přidáním řetězců cukru
Polylaktosaminové přílohy, které chrání glyocoprotein před degradací lysozomálními proteázami
Významné množství polylaktosaminoglykanu a kyseliny sialové k transverzi trans- Golgiho cisterny .
poly-N-acetyllaktosaminové skupiny, které se podílejí na interakcích se selektinem a jinými proteiny vážícími glykan

Funkce

Glykoproteiny LAMP1 a LAMP2 obsahují 50% všech lyzozomálních membránových proteinů a předpokládá se, že jsou částečně zodpovědné za udržování lysozomální integrity, pH a katabolismu . Exprese glykoproteinů LAMP1 a LAMP2 je spojena, protože nedostatky v genu LAMP1 povedou ke zvýšené expresi glykoproteinů LAMP2. Předpokládá se tedy, že tito dva sdílejí podobné funkce in vivo . To však činí stanovení přesné funkce LAMP1 obtížným, protože zatímco fenotyp s nedostatkem LAMP1 se kvůli regulaci LAMP2 nahoru málo liší od divokého typu , dvojitě deficitní fenotyp LAMP1 / LAMP2 vede k embryonální letalitě.

Ačkoli glykoproteiny LAMP1 primárně přebývají přes lysozomální membrány, v určitých případech mohou být exprimovány přes plazmatickou membránu buňky. K expresi LAMP1 na buněčném povrchu může dojít v důsledku lysozomální fúze s buněčnou membránou. Exprese buněčného povrchu LAMP1 může sloužit jako ligand pro selektiny a může pomoci zprostředkovat adhezi buňka-buňka . Exprese buněčného povrchu LAMP1 je tedy pozorována v buňkách s migračními nebo invazivními funkcemi, jako jsou cytotoxické T buňky , destičky a makrofágy . Exprese buněčného povrchu LAMP1 a LAMP2 je také často pozorována v rakovinných buňkách, zejména rakovinách s vysokým metastatickým potenciálem, jako je karcinom tlustého střeva a melanom, a bylo prokázáno, že koreluje s jejich metastatickým potenciálem.

Role v rakovině

LAMP1 exprese na povrchu nádorových buněk bylo pozorováno u mnoha různých typů rakoviny, zejména ve vysoce metastatické rakoviny, jako je rakovina slinivky břišní , rakoviny tlustého střeva a melanomu . Struktura LAMP1 koreluje s diferenciací a metastatickým potenciálem nádorových buněk, protože se předpokládá, že pomáhá zprostředkovat adhezi a migraci buněčných buněk . Ve skutečnosti, je přilnavost některých rakovinových buněk na extracelulární matrix je zprostředkován interakcí mezi LAMP1 a LAMP2 a E-selektinu a galektiny , s svítilen slouží jako ligandy pro molekuly buněčné adheze.

Exprese buněčné membrány LAMP-1 pozorovaná u následujících typů rakoviny:

Viz také

Klastr diferenciace

Reference

Další čtení

Chang MH, Karageorgos LE, Meikle PJ (2003). "CD107a (LAMP-1) a CD107b (LAMP-2)". Journal of Biological Regulators and Homeostatic Agents . 16 (2): 147–51. PMID 12144129 .
Schleutker J, Haataja L, Renlund M, Puhakka L, Viitala J, Peltonen L, Aula P (listopad 1991). „Potvrzení chromozomální lokalizace genů lidské lampy a jejich vyloučení jako kandidátských genů pro Salla nemoc“. Lidská genetika . 88 (1): 95–7. doi : 10,1007/BF00204936 . PMID 1959930 . S2CID 31520394 .
Carlsson SR, Fukuda M (listopad 1990). "Polylaktosaminoglykany lidských lysozomálních membránových glykoproteinů lampa-1 a lampa-2. Lokalizace na peptidových hlavních kostech" . The Journal of Biological Chemistry . 265 (33): 20488–95. doi : 10,1016/S0021-9258 (17) 30530-6 . PMID 2243102 .
Mattei MG, Matterson J, Chen JW, Williams MA, Fukuda M (květen 1990). „Dva lidské lysozomální membránové glykoproteiny, h-lamp-1 a h-lamp-2, jsou kódovány geny lokalizovanými do chromozomu 13q34, respektive chromozomu Xq24-25“ . The Journal of Biological Chemistry . 265 (13): 7548–51. doi : 10,1016/S0021-9258 (19) 39148-3 . PMID 2332441 .
Carlsson SR, Fukuda M (prosinec 1989). „Struktura lidského lysozomálního membránového glykoproteinu 1. Přiřazení disulfidových vazeb a vizualizace uspořádání jeho domény“ . The Journal of Biological Chemistry . 264 (34): 20526–31. doi : 10,1016/S0021-9258 (19) 47094-4 . PMID 2584229 .
Mane SM, Marzella L, Bainton DF, Holt VK, Cha Y, Hildreth JE, srpen JT (leden 1989). „Purifikace a charakterizace lidských lysozomálních membránových glykoproteinů“. Archivy biochemie a biofyziky . 268 (1): 360–78. doi : 10,1016/0003-9861 (89) 90597-3 . PMID 2912382 .
Viitala J, Carlsson SR, Siebert PD, Fukuda M (červen 1988). "Molekulární klonování cDNA kódujících lampu A, lidský lysozomální membránový glykoprotein se zjevným Mr přibližně rovným 120 000" . Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických . 85 (11): 3743–7. Bibcode : 1988 PNAS ... 85,3743V . doi : 10,1073/pnas.85.11.3743 . PMC 280294 . PMID 3131762 .
Howe CL, Granger BL, Hull M, Green SA, Gabel CA, Helenius A, Mellman I (říjen 1988). „Odvozená proteinová sekvence, oligosacharidy a membránová inzerce 120-kDa lysozomálního membránového glykoproteinu (lgp120): identifikace vysoce konzervované rodiny lysozomálních membránových glykoproteinů“ . Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických . 85 (20): 7577–81. Bibcode : 1988 PNAS ... 85,7577H . doi : 10,1073/pnas.85.20.7577 . PMC 282235 . PMID 3174652 .
Fukuda M, Viitala J, Matteson J, Carlsson SR (prosinec 1988). "Klonování cDNA kódujících lidské lysozomální membránové glykoproteiny, h-lamp-1 a h-lamp-2. Srovnání jejich odvozených sekvencí aminokyselin" . The Journal of Biological Chemistry . 263 (35): 18920–8. doi : 10,1016/S0021-9258 (18) 37370-8 . PMID 3198605 .
Ohno H, Stewart J, Fournier MC, Bosshart H, Rhee I, Miyatake S, Saito T, Gallusser A, Kirchhausen T, Bonifacino JS (září 1995). „Interakce třídicích signálů na bázi tyrosinu s proteiny spojenými s klatrinem“. Věda . 269 (5232): 1872–5. Bibcode : 1995Sci ... 269,1872O . doi : 10,1126/věda.7569928 . PMID 7569928 .
Carlsson SR, Lycksell PO, Fukuda M (červenec 1993). "Přiřazení míst připojení O-glykanu k kloubovým oblastem lidských lysozomálních membránových glykoproteinů lampa-1 a lampa-2". Archivy biochemie a biofyziky . 304 (1): 65–73. doi : 10.1006/abbi.1993.1322 . PMID 8323299 .
Sawada R, Jardine KA, Fukuda M (dub 1993). „Geny hlavních lysozomálních membránových glykoproteinů, lampa-1 a lampa-2. 5'-lemující sekvence genu pro lampu-2 a srovnání exonové organizace ve dvou genech“ . The Journal of Biological Chemistry . 268 (12): 9014–22. doi : 10,1016/S0021-9258 (18) 52972-0 . PMID 8517882 .
Rohrer J, Schweizer A, Russell D, Kornfeld S (únor 1996). "Cílení Lamp1 na lysozomy závisí na vzdálenosti jeho cytoplazmatického motivu třídění tyrosinu ocasem vzhledem k membráně" . The Journal of Cell Biology . 132 (4): 565–76. doi : 10,1083/jcb.132.4.565 . PMC 2199866 . PMID 8647888 .
Höning S, Sandoval IV, von Figura K (srpen 1998). „Motiv na bázi di-leucinu v cytoplazmatickém ocasu LIMP-II a tyrosinázy zprostředkovává selektivní vazbu AP-3“ . EMBO Journal . 17 (5): 1304–14. doi : 10,1093/emboj/17.5.1304 . PMC 1170479 . PMID 9482728 .
Furuta K, Yang XL, Chen JS, Hamilton SR, srpen JT (květen 1999). „Diferenciální exprese lysozomem spojených membránových proteinů v normálních lidských tkáních“. Archivy biochemie a biofyziky . 365 (1): 75–82. doi : 10,1006/abbi.1999.1147 . PMID 10222041 .
Raposo G, Moore M, Innes D, Leijendekker R, Leigh-Brown A, Benaroch P, Geuze H (říjen 2002). „Lidské makrofágy hromadí částice HIV-1 v kompartmentech MHC II“. Provoz . 3 (10): 718–29. doi : 10,1034/j.1600-0854.2002.31004.x . PMID 12230470 . S2CID 7055266 .
Zhang H, Li XJ, Martin DB, Aebersold R (červen 2003). „Identifikace a kvantifikace N-vázaných glykoproteinů pomocí hydrazidové chemie, stabilního značení izotopů a hmotnostní spektrometrie“. Přírodní biotechnologie . 21 (6): 660–6. doi : 10,1038/nbt827 . PMID 12754519 . S2CID 581283 .

externí odkazy

LAMP1+protein,+člověk v USA National Library of Medicine Lékařská témata (MeSH)
PDBe-KB poskytuje přehled všech strukturních informací dostupných v PDB pro membránový glykoprotein 1 spojený s lidským lysozomem

Tento článek včlení text z Národní lékařské knihovny Spojených států , který je veřejně dostupný .

Languages

In other projects