KCNK2 - KCNK2

KCNK2
Tillgängliga strukturer
PDB	Ortologisökning: PDBe RCSB
Lista över PDB -ID -koder
	4TWK
Identifierare
Alias	KCNK2 , K2p2.1, TPKC1, TREK, TREK-1, TREK1, hTREK-1c, hTREK-1e, kalium tvåporig domän kanal underfamilj K medlem 2
Externa ID: n	OMIM : 603219 MGI : 109366 HomoloGene : 7794 GenKort : KCNK2
Genläge ( mänskligt )
Chr.	Kromosom 1 (människa)
Slutet	215 237 090 bp
Genläge ( mus )
Chr.	Kromosom 1 (mus)
Slutet	189 402 273 bp
RNA -uttrycksmönster
	Mer referensuttrycksdata
Genontologi
Molekylär funktion	• kaliumkanalaktivitet ; • spänningsstyrda kaliumkanalaktivitet ; • inhibitoraktivitet kaliumkanal ; • utåt likriktarkaliumkanalaktivitet ; • kaliumjon läckkanalaktivitet;
Cellulär komponent	• axonterminal ; • integrerad komponent i membran ; • endoplasmatiskt retikulamembran ; • membran ; • spänningsstyrt kaliumkanalkomplex ; • plasmamembran ; • astrocytprojektion ; • kalyx av hållet ; • cellyta ; • axon ; • neuronal cellkropp ; • apikalt plasmamembran ; • endoplasmatiskt retikulum ; • neuronprojektion ; • kärna ; • integrerad komponent i plasmamembran;
Biologisk process	• cochleautveckling ; • G-proteinkopplad receptorsignalväg ; • positiv reglering av celldöd ; • positiv reglering av cellulärt svar på hypoxi ; • reglering av membranpotential ; • utveckling av hjärtkammare ; • svar på mekanisk stimulans ; • minne ; • jontransport ; • kaliumjontransport ; • svar till axonskada ; • kaliumjontransmembrantransport ; • negativ reglering av hjärtmuskelcellspridning ; • cellulärt svar på hypoxi ; • negativ reglering av DNA -biosyntetisk process ; • stabilisering av membranpotential;
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	3776
	16526
	ENSG00000082482
	ENSMUSG00000037624
	O95069
	P97438
	NM_001017424 ; NM_001017425 ; NM_014217
	NM_001159850 ; NM_001281847 ; NM_001281848 ; NM_010607 ; NM_001357119
	NP_001017424 ; NP_001017425 ; NP_055032
	NP_001153322 ; NP_001268776 ; NP_001268777 ; NP_034737 ; NP_001344048
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

Kaliumkanal -underfamilj K -medlem 2 är ett protein som hos människor kodas av KCNK2 -genen .

Denna gen kodar för K _2P 2.1, en lipidgaterad jonkanal som tillhör kaliumkanalproteinfamiljen med två porer. Denna typ av kaliumkanal bildas av två homodimerer som skapar en kanal som släpper ut kalium ur cellen för att styra vilande membranpotential. Kanalen öppnas av anjonisk lipid, vissa bedövningsmedel, membransträckning, intracellulär acidos och värme. Tre transkriptvarianter som kodar för olika isoformer har hittats för denna gen.

Funktion i neuroner

Ett annat namn för denna kanal är TREK-1 . TREK-1 är en del av underfamiljen av mekano-gateda kaliumkanaler som finns i däggdjursneuroner. De kan grindas på både kemiska och fysiska sätt och kan öppnas via både fysiska stimuli och kemiska stimuli. TREK-1-kanaler finns i en mängd olika vävnader, men är särskilt rikliga i hjärnan och hjärtat och ses i olika typer av neuroner. Den C-terminala av TREK-1 kanaler spelar en roll i den Mekanosensitivitet av kanalerna.

I nervcellerna i centrala nervsystemet är TREK-1-kanaler viktiga vid fysiologiska, patofysiologiska och farmakologiska processer, inklusive att ha en roll vid elektrogenes , ischemi och anestesi . TREK-1 har en viktig roll vid neuroprotektion mot epilepsi och hjärn- och ryggmärgsiskemi och utvärderas som ett potentiellt mål för nya utvecklingar av terapeutiska medel för neurologi och anestesiologi.

I avsaknad av ett korrekt fungerande cytoskelet kan TREK-1-kanaler fortfarande öppna via mekanisk grindning. De cellmembran fungerar oberoende av cytoskelettet och tjockleken och krökningen hos membranet är i stånd att modulera aktiviteten av de TREK-1 kanaler. Förändringen i tjocklek tros kunna avkännas av en amfipatisk helix som sträcker sig från membranets inre broschyr.

Insättning av vissa föreningar i membranet, inklusive inhalerade bedövningsmedel och propofol, aktiverar TREK-1 genom enzymet fosfolipas D2 (PLD2). Före tillsatsen av bedövningsmedel associeras PLD2 med GM-1 lipidflottor. Efter bedövning, enzymet eller ett komplex av enzymet och kanaltrafiken till PIP2 -domäner där enzymet gör fosfatidsyra som öppnar kanalen.

Se även

Tandem pordomän kaliumkanal

Referenser

Vidare läsning

Goldstein SA, Bockenhauer D, O'Kelly I, Zilberberg N (2001). "Kaliumläckagekanaler och KCNK-familjen av två-P-domänunderenheter" . Nat. Rev. Neurosci . 2 (3): 175–84. doi : 10.1038/35058574 . PMID 11256078 . S2CID 9682396 .
Honoré E (2007). "Den neuronala bakgrunden K2P -kanaler: fokus på TREK1". Nat. Rev. Neurosci . 8 (4): 251–61. doi : 10.1038/nrn2117 . PMID 17375039 . S2CID 21421846 .
Fink M, Duprat F, Lesage F, et al. (1997). "Kloning, funktionellt uttryck och hjärnlokalisering av en ny okonventionell utåt likriktare K+ kanal" . EMBOJ . 15 (24): 6854–62. doi : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb01077.x . PMC 452511 . PMID 9003761 .
Patel AJ, Honoré E, Lesage F, et al. (1999). "Inhalationsanestetika aktiverar K+ -kanaler med två porer i domänen". Nat. Neurosci . 2 (5): 422–6. doi : 10.1038/8084 . PMID 10321245 . S2CID 23092576 .
Meadows HJ, Benham CD, Cairns W, et al. (2000). "Kloning, lokalisering och funktionellt uttryck för den humana ortologen av TREK-1 kaliumkanalen". Pflügers Arch . 439 (6): 714–22. doi : 10.1007/s004240050997 . PMID 10784345 .
Maylie J, Adelman JP (2001). "Strål mig, Scottie! TREK -kanaler svänger åt båda hållen". Nat. Neurosci . 4 (5): 457–8. doi : 10.1038/87402 . PMID 11319549 . S2CID 5982574 .
Bockenhauer D, Zilberberg N, Goldstein SA (2001). "KCNK2: reversibel omvandling av ett hippocampalt kaliumläckage till en spänningsberoende kanal" . Nat. Neurosci . 4 (5): 486–91. doi : 10.1038/87434 . PMID 11319556 . S2CID 7658182 .
Enyeart JJ, Xu L, Danthi S, Enyeart JA (2003). "En ACTH- och ATP-reglerad K+ -kanal för bakgrund i adrenokortikala celler är TREK-1" . J. Biol. Chem . 277 (51): 49186–99. doi : 10.1074/jbc.M207233200 . PMID 12368289 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering och inledande analys av mer än 15 000 cDNA-sekvenser i full längd av människor och mus" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Imabayashi H, Mori T, Gojo S, et al. (2003). "Omdifferentiering av dedifferentierade kondrocyter och kondrogenes av mänskliga benmärgstromalceller via kondrosfärbildning med uttrycksprofilering genom storskalig cDNA-analys". Exp. Cell Res . 288 (1): 35–50. doi : 10.1016/S0014-4827 (03) 00130-7 . PMID 12878157 .
Miller P, Peers C, Kemp PJ (2004). "Polymodal reglering av hTREK1 med pH, arakidonsyra och hypoxi: fysiologisk påverkan vid acidos och alkalos". Am. J. Physiol., Cell Physiol . 286 (2): C272–82. doi : 10.1152/ajpcell.00334.2003 . PMID 14522822 .
Fu GK, Wang JT, Yang J, et al. (2005). "Cirkulär snabb amplifiering av cDNA-ändar för hög genomströmningskloning av partiella gener". Genomik . 84 (1): 205–10. doi : 10.1016/j.ygeno.2004.01.011 . PMID 15203218 .
Kennard LE, Chumbley JR, Ranatunga KM, et al. (2005). "Hämning av den mänskliga kaliumkanalen med två porer, TREK-1, av fluoxetin och dess metabolit norfluoxetin" . Br. J. Pharmacol . 144 (6): 821–9. doi : 10.1038/sj.bjp.0706068 . PMC 1576064 . PMID 15685212 .
Miller P, Kemp PJ, Peers C (2005). "Strukturella krav för O2-avkänning av den mänskliga tandem-P-domänkanalen, hTREK1". Biochem. Biofys. Res. Kommun . 331 (4): 1253–6. doi : 10.1016/j.bbrc.2005.04.042 . PMID 15883010 .
Murbartián J, Lei Q, Sando JJ, Bayliss DA (2005). "Sekventiell fosforylering förmedlar receptor- och kinasinducerad hämning av TREK-1 bakgrundskaliumkanaler" . J. Biol. Chem . 280 (34): 30175–84. doi : 10.1074/jbc.M503862200 . PMID 16006563 .
Hughes S, Magnay J, Foreman M, et al. (2006). "Uttryck av den mekanokänsliga 2PK+ -kanalen TREK-1 i humana osteoblaster". J. Cell. Physiol . 206 (3): 738–48. doi : 10.1002/jcp.20536 . PMID 16250016 . S2CID 1788790 .
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al. (2006). "Diversifiering av transkriptionell modulering: storskalig identifiering och karakterisering av förmodade alternativa promotorer för mänskliga gener" . Genome Res . 16 (1): 55–65. doi : 10.1101/gr.4039406 . PMC 1356129 . PMID 16344560 .

externa länkar

KCNK2+protein,+människa vid US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)

Denna artikel innehåller text från United States National Library of Medicine , som är offentligt .

Languages

In other projects