Endosfera - Endosphere
Alguns microrganismos, como os endófitos , penetram e ocupam os tecidos internos da planta, formando o microbioma endosférico. Os fungos micorrízicos arbusculares e outros fungos endofíticos são os colonizadores dominantes da endosfera. Bactérias e, até certo ponto , arquéias , são membros importantes das comunidades da endosfera. Alguns desses micróbios endofíticos interagem com seu hospedeiro e fornecem benefícios óbvios para as plantas. Ao contrário da rizosfera e do rizoplano, as endosferas abrigam comunidades microbianas altamente específicas. A comunidade endofítica da raiz pode ser muito distinta da comunidade do solo adjacente. Em geral, a diversidade da comunidade endofítica é menor do que a diversidade da comunidade microbiana fora da planta. A identidade e diversidade do microbioma endofítico de tecidos acima e abaixo do solo também podem diferir dentro da planta.
Folhas e bactérias
A exposição à luz pode desencadear a fotossíntese nas folhas das plantas, como as folhas verdes , e aumentar as concentrações de produtos fotossintéticos, como a glicose, no tecido foliar. As bactérias existentes nas superfícies das folhas podem responder aos produtos fotossintéticos disponíveis e migrar para o tecido foliar por quimiotaxia em direção a gradientes de concentração de nutrientes . Uma vez que as bactérias estão dentro do tecido foliar, elas não podem ser lavadas, representando um risco para os consumidores. Diversas bactérias, como Escherichia coli e Salmonella enterica , são capazes de se fixar na microestrutura na superfície das folhas das plantas, como tricomas , estômatos e sulcos, e se localizar em locais que não são acessíveis para água de lavagem e desinfetantes. As bactérias também são capazes de se infiltrar em aberturas disponíveis na superfície da folha, como estômatos, cortes e feridas, para atingir profundidades de dezenas de micrômetros abaixo da epiderme foliar . Esta infiltração pode representar um risco para o consumo humano de folhas verdes cruas.
A luz é uma das forças motrizes que podem promover a infiltração de bactérias patogênicas nas folhas das plantas. A incubação de S. enterica ( sorovar Typhimurium ) em folhas de alface iceberg na luz levou à associação de bactérias perto de estômatos abertos e infiltração no tecido foliar. No entanto, uma condição escura causou um padrão de fixação disperso na superfície da folha e uma infiltração estomática pobre. Nutrientes, como glicose e sacarose , produzidos por células fotossinteticamente ativas no tecido foliar durante a exposição à luz, são atrativos para bactérias que podem estar inicialmente presentes na superfície da folha. A abertura dos estômatos à luz abre uma oportunidade para as bactérias se transportarem por quimiotaxia em direção aos gradientes de nutrientes para o interior da folha. Muitas plantas desenvolveram maquinaria de defesa estomática para fechar os estômatos após a percepção das estruturas da superfície bacteriana, conhecidas como padrões moleculares associados a micróbios (MAMPs). No entanto, nem sempre é bem-sucedido e alguns patógenos humanos demonstraram penetrar no interior da folha por meio de um processo envolvido com quimiotaxia e motilidade .