Outron - Outron
Un outron è una sequenza nucleotidica all'estremità 5 'del trascritto primario di un gene che viene rimosso da una forma speciale di splicing dell'RNA durante la maturazione del prodotto finale dell'RNA. Mentre le sequenze di introni si trovano all'interno del gene, le sequenze di outron si trovano al di fuori del gene.
Caratteristiche
L'outron è una sequenza simile a un introne che possiede caratteristiche simili come il contenuto G + C e un sito accettore di giunzione che è il segnale per il trans- splicing . Tale trans sito -splice è essenzialmente definito come accettore (3 ') sito di splicing senza donatore a monte (5') sito di splicing.
Negli eucarioti quali euglenozoans , dinoflagellati , spugne , nematodi , cnidari , ctenofori , vermi piatti , crostacei , chetognati , rotiferi , e tunicati , la lunghezza del leader spliced (SL) outrons vanno da 30 a 102 nucleotidi (nt) , con l'esone SL lunghezza compresa tra 16 e 51 nt e la lunghezza completa dell'SL RNA compresa tra 46 e 141 nt.
in lavorazione
Nello splicing cis standard , il sito di giunzione del donatore in posizione a monte è richiesto insieme a un sito accettore situato in posizione a valle sulla stessa molecola di pre-RNA. Al contrario, il trans- splicing SL si basa su un sito di giunzione accettore 3 'sul tronco e un sito di giunzione donatore 5' (dinucleotide GU) situato su una molecola di RNA separata, l'RNA SL. Inoltre, l'outron dell'mRNA prematura contiene un branchpoint adenosina - seguita da una a valle del tratto polypyrimidine - che interagisce con l'introne-come porzione della SL RNA per formare un sottoprodotto ramificato 'Y', ricorda il lazo struttura formata durante introne splicing . Macchinari nucleare poi risolve questo 'Y' struttura ramificata dal trans -splicing la sequenza di RNA SL al 3 ' trans sito accettore -splice (AG dinucleotide) del pre-mRNA.
Quando gli outrons vengono elaborati, l'esone SL viene trans -accoppiato a siti accettori distinti, spaiati, a valle adiacenti a ciascun frame di lettura aperto del pre-mRNA policistronico, portando a trascritti con cappuccio maturo distinti.
