Facteur de transcription Gal4 - Gal4 transcription factor
| Protéine régulatrice GAL4 | |||||||
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| Identifiants | |||||||
| Organisme | |||||||
| symbole | GAL4 | ||||||
| Entrez | 855828 | ||||||
| UniProt | P04386 | ||||||
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Le facteur de transcription Gal4 est un régulateur positif de l'expression génique des gènes induits par le galactose. Cette protéine représente une grande famille fongique de facteurs de transcription, la famille Gal4, qui comprend plus de 50 membres dans la levure Saccharomyces cerevisiae, par exemple Oaf1, Pip2, Pdr1, Pdr3, Leu3.
Gal4 reconnaît les gènes avec UAS G , une séquence d'activation en amont , et les active. Dans les cellules de levure, les cibles principales sont GAL1 ( galactokinase ), GAL10 ( UDP-glucose 4-épimérase ) et GAL7 ( galactose-1-phosphate uridylyltransférase ), trois enzymes nécessaires au métabolisme du galactose. Cette liaison s'est également avérée utile dans la construction du système GAL4/UAS , une technique pour contrôler l'expression chez les insectes. Chez la levure, Gal4 est par défaut réprimé par Gal80, et activé en présence de galactose car Gal3 se lie à Gal80.
Domaines
Deux domaines exécutifs, les domaines de liaison à l'ADN et d'activation, assurent la fonction clé de la protéine Gal4 conforme à la plupart des facteurs de transcription.
liaison à l'ADN
Gal4 N-terminal est un doigt de zinc et appartient à la famille fongique Zn(2)-C6 . Il forme un cluster Zn - thiolate de cystéines et reconnaît spécifiquement l'UAS G dans le promoteur GAL1.
Transactivation Gal4
Localisé à l'extrémité C-terminale, il appartient à la famille des domaines de transactivation des neuf acides aminés , 9aaTAD, avec Oaf1, Pip2, Pdr1, Pdr3, mais aussi p53 , E2A , MLL .
Régulation
Le galactose induit la transcription médiée par Gal4, bien que le glucose provoque une répression sévère.
Dans le cadre de la régulation Gal4, la protéine inhibitrice Gal80 reconnaît et se lie à la région Gal4 (853-874 aa).
La protéine inhibitrice Gal80 est séquestrée par la protéine régulatrice Gal3 de manière galactose dépendante. Cela permet à Gal4 de fonctionner lorsqu'il y a du galactose.
Mutants
Le mutant Gal4 avec perte de fonction gal4-64 (1-852 aa, délétion de Gal4 C-terminal 29 aa) a perdu à la fois l'interaction avec Gal80 et la fonction d'activation.
Dans le mutant Gal4 réverti Gal4C-62, une séquence (QTAY N AFMN) avec le motif 9aaTAD a émergé et a restauré la fonction d'activation de la protéine Gal4.
Constructions inactives
Le domaine d'activation Gal4 est inhibé par le domaine C-terminal dans certaines constructions Gal4.
Fonction
Cible
Transcription
La fonction d'activation Gal4 est médiée par MED15 (Gal11).
La protéine Gal4 interagit également avec d'autres médiateurs de la transcription comme le complexe Tra1, TAF9 et SAGA/MED15.
Protéosome
Une sous-unité de la protéine régulatrice Sug2 du protéasome 26 S a une interaction moléculaire et fonctionnelle avec la fonction Gal4. Le renouvellement protéolytique du facteur de transcription Gal4 n'est pas requis pour la fonction in vivo. La monoubiquitination Gal4 native protège de la déstabilisation médiée par le 19S dans des conditions inductrices.
Application
La large utilisation du Gal4 est dans le criblage à deux hybrides de levure pour cribler ou doser les interactions protéine-protéine dans les cellules eucaryotes de la levure à l'humain.
Dans le système GAL4/UAS , la protéine Gal4 et la région d'activation en amont Gal4 (UAS) sont utilisées pour étudier l'expression et la fonction des gènes dans des organismes tels que la mouche des fruits.
La Gal4 et la protéine inhibitrice Gal80 ont trouvé une application dans une technique génétique pour créer des cellules homozygotes individuellement marquées appelées MARCM (Analyse en mosaïque avec un marqueur cellulaire répressible).
Voir également
Les références
Lectures complémentaires
- Gal4p sur WikiGenes
- Traven A, Jelicic B, Sopta M (mai 2006). « Yeast Gal4 : un paradigme transcriptionnel revisité » . Rapports de l'EMBO . 7 (5) : 496-9. doi : 10.1038/sj.embor.7400679 . PMC 1479557 . PMID 16670683 .
