UFD1L - UFD1L

UFD1
Saatavilla olevat rakenteet
ATE	Ortologihaku : PDBe RCSB
Luettelo ATE: n tunnuskoodeista
	2YUJ , 5C1B
Tunnisteet
Aliakset	UFD1 , UFD1L, ubikitiinifuusion hajoaminen 1, kuten (hiiva), ubikitiinintunnistustekijä ER: ään liittyvässä hajoamisessa 1
Ulkoiset tunnukset	OMIM : 601754 MGI : 109353 HomoloGene : 39090 Geenikortit : UFD1
Geenin sijainti ( ihminen )
Chr.	Kromosomi 22 (ihminen)
Loppu	19 479 202 bp
Geenin sijainti ( hiiri )
Chr.	Kromosomi 16 (hiiri)
Loppu	18835261 bp
RNA: n ilmentymisen kuvio
	Lisää vertailulausetietoja
Geenin ontologia
Molekyylifunktio	• GO: 0032403 proteiinia sisältävä kompleksisitoutuminen ; • ATPaasiin sitoutuminen ; • K48-sitoutunut polyubikitiinimodifikaatiosta riippuvainen proteiiniin sitoutuminen ; • signalointireseptorin sitoutuminen ; • GO: 0001948 proteiinin sitoutuminen ; • tiolista riippuvainen deubikitinaasi;
Solukomponentti	• sytoplasma ; • sytosoli ; • ydin ; • UFD1-NPL4-kompleksi ; • nukleoplasma ; • endoplasman verkkokalvo ; • VCP-NPL4-UFD1 AAA ATPaasikompleksi;
Biologinen prosessi	• virheetöntä translesion synteesi ; • luuston kehitys ; • retrogradinen proteiinin kuljetuksen, ER sytosolissa ; • ER-liittyvät väärin laskostuneen proteiinin katabolisten prosessi ; • proteasomin-välitteisen ubikitiini-riippuvainen proteiinien katabolisen prosessi ; • ubikitiini-riippuvainen proteiinien katabolisen prosessi ; • proteiinin deubiquitination ; • negatiivisen säätelyn tyypin I interferonituotanto ; • RIG-I-signalointireitin negatiivinen säätely;
	Lähteet: Amigo / QuickGO
Ortologit
	7353
	22230
	ENSG00000070010
	ENSMUSG00000005262
	Q92890
	P70362
	NM_001035247 ; NM_005659 ; NM_001362910
	NM_011672
	NP_001030324 ; NP_005650 ; NP_001349839
	NP_035802
	Wikidata
Näytä / muokkaa ihmistä	Näytä / muokkaa hiirtä

Ubiquitin- fuusiohajoamisproteiini 1 -homologi on proteiini, jota ihmisissä koodaa UFD1L- geeni .

Toiminto

Tämän geenin koodaama proteiini muodostaa kompleksin kahden muun proteiinin, NPL4: n ja VCP: n, kanssa, mikä on välttämätöntä ubikinitoitujen proteiinien hajoamiseksi. Lisäksi tämä kompleksi ohjaa mitoottisen karan purkamista ja suljetun ydinkuoren muodostumista mitoosin jälkeen. Tämän geenin mutaatiot ovat liittyneet Catch 22 -oireyhtymään sekä sydän- ja kraniofaciaalivioihin. Vaihtoehtoinen liitos johtaa useisiin transkriptiomuunnelmiin, jotka koodaavat erilaisia isoformeja.

Vuorovaikutukset

UFD1L on osoitettu olevan vuorovaikutuksessa kanssa NPLOC4 .

Viitteet

Lisälukemista

Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: yksinkertainen menetelmä korvata eukaryoottisten mRNA: iden korkkirakenne oligoribonukleotideilla". Geeni . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Täysipituisesti rikastetun ja 5'-pään rikastetun cDNA-kirjaston rakentaminen ja karakterisointi". Geeni . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Novelli G, Mari A, Amati F, Colosimo A, Sangiuolo F, Bengala M, Conti E, Ratti A, Bordoni R, Pizzuti A, Baldini A, Crinelli R, Pandolfi F, Magnani M, Dallapiccola B (1998). "Ihmisen ubikvitiinifuusio-hajoamisgeenin (UFD1L) rakenne ja ilmentyminen". Biochim. Biophys. Acta . 1396 (2): 158–62. doi : 10.1016 / s0167-4781 (97) 00211-x . PMID 9540831 .
Yamagishi H, Garg V, Matsuoka R, Thomas T, Srivastava D (1999). "Molekyylireitti, joka paljastaa ihmisen sydän- ja kraniofaciaalisten vikojen geneettisen perustan". Tiede . 283 (5405): 1158–61. doi : 10.1126 / tiede.283.5405.1158 . PMID 10024240 .
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2000). "DNA-kloonaus käyttämällä in vitro -kohtaista rekombinaatiota" . Genome Res . 10 (11): 1788–95. doi : 10.1101 / gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
Botta A, Tandoi C, Fini G, Calabrese G, Dallapiccola B, Novelli G (2001). "Ihmisen NPL4: ää koodaavan geenin kloonaus ja karakterisointi, joka on vuorovaikutuksessa ubikvitiinin fuusio-hajoamisproteiinin (UFD1L) kanssa". Geeni . 275 (1): 39–46. doi : 10.1016 / S0378-1119 (01) 00649-7 . PMID 11574150 .
Amati F, Conti E, Botta A, Amicucci P, Dallapiccola B, Novelli G (2002). "Ihmisen ubikvitiini-fuusion hajoamisen 1 kaltaisen geenin (UFD1L) 5'-reunustavan alueen toiminnallinen karakterisointi". Cell Biochem. Funet . 20 (2): 163–70. doi : 10.1002 / cbf.966 . PMID 11979512 .
Amati F, Condò I, Conti E, Sangiuolo F, Dallapiccola B, Testi R, Novelli G (2003). "Ufd1l-geenituotteen solunsisäisen jakautumisen ja apoptoosiin osallistumisen analysointi yliekspressiotutkimuksilla". Cell Biochem. Funet . 21 (3): 263–7. doi : 10.1002 / cbf.1021 . PMID 12910480 .
Ye Y, Shibata Y, Yun C, Ron D, Rapoport TA (2004). "Kalvoproteiinikompleksi välittää retro-translokaation ER-ontelosta sytosoliin". Luonto . 429 (6994): 841–7. doi : 10.1038 / nature02656 . PMID 15215856 .
Collins JE, Wright CL, Edwards CA, Davis MP, Grinham JA, Cole CG, Goward ME, Aguado B, Mallya M, Mokrab Y, Huckle EJ, Beare DM, Dunham I (2004). "Genomimerkintöihin perustuva lähestymistapa ihmisen ORFeomen kloonaamiseen" . Genome Biol . 5 (10): R84. doi : 10.1186 / gb-2004-5-10-r84 . PMC 545604 . PMID 15461802 .
Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (2004). "ORFeomesta biologiaan: toiminnallinen genomiikan putki" . Genome Res . 14 (10B): 2136–44. doi : 10.1101 / gr.2576704 . PMC 528930 . PMID 15489336 .
Voi JH, Yang JO, Hahn Y, Kim MR, Byun SS, Jeon YJ, Kim JM, Song KS, Noh SM, Kim S, Yoo HS, Kim YS, Kim NS (2005). "Transkriptoanalyysi ihmisen mahasyövästä". Mamm. Genomi . 16 (12): 942–54. doi : 10.1007 / s00335-005-0075-2 . PMID 16341674 .
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber W, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (2006). "LIFEdb-tietokanta vuonna 2006" . Nukleiinihapot Res . 34 (tietokantaan liittyvä ongelma): D415-8. doi : 10.1093 / nar / gkj139 . PMC 1347501 . PMID 16381901 .
McConnell E, Lass A, Wójcik C (2007). "Ufd1-Npl4 on negatiivinen koleratoksiinin uudelleensiirron säätelijä". Biochem. Biophys. Res. Commun . 355 (4): 1087–90. doi : 10.1016 / j.bbrc.2007.02.077 . PMID 17331469 .
Cao J, Wang J, Qi W, Miao HH, Wang J, Ge L, DeBose-Boyd RA, Tang JJ, Li BL, Song BL (2007). "Ufd1 on gp78: n kofaktori ja sillä on keskeinen rooli kolesterolin metaboliassa säätelemällä HMG-CoA-reduktaasin stabiilisuutta" . Cell Metab . 6 (2): 115–28. doi : 10.1016 / j.cmet.2007.07.002 . PMID 17681147 .

Tämä artikkeli on geeni on ihmisen kromosomissa 22 on tynkä . Voit auttaa Wikipediaa laajentamalla sitä .

Languages

In other projects

UFD1L - UFD1L

Sisällys

Toiminto

Vuorovaikutukset

Viitteet

Lisälukemista