Chromatiales

De Chromatiales formează un ordin în cadrul Gammaproteobacteria . La fel ca toate proteobacteriile, speciile din acest ordin sunt gram-negative . Cele două familii Chromatiaceae și Ectothiorhodospiraceae aparțin grupului non-taxonomic al bacteriilor purpurii de sulf : din hidrogen sulfurat se oxidează pentru a forma sulfat .

Caracteristici

Multe bacterii de acest ordin au capacitatea de a fotosinteza . Sunt anaerobe sau microaerofile și apar în izvoarele de sulf și în apa dezoxigenată. Spre deosebire de plante sau alge , acestea nu folosesc apa ca agent de reducere și, prin urmare, nu produc oxigen . În schimb, hidrogenul sulfurat este oxidat în sulf elementar. Astfel aparțin bacteriilor violete fototrofice de sulf. Speciile din familia Halothiobacillaceae nu pot obține energie prin fotosinteză.

Tipurile de Chromatiaceae și Ectothiorhodospiraceae se pot distinge prin micile granule (globule) formate din oxidarea sulfului elementar . Reprezentanții Chromatiaceae le depozitează în interior, specii de Ectothiorhodospiraceae în afara celulei. Ectothiorhodospiraceae, precum și Halothiobacillaceae , conțin specii halofile (iubitoare de sare) și alcalifile . Bacteriile alcalifile trăiesc în medii cu pH ridicat. Specia Ectothiorhodospira haloalkaliphila atinge o creștere optimă la valori de pH cuprinse între 8,5 și 10,0.

Sistematică

O listă a celor 6 familii cu unele genuri (începând cu ianuarie 2019):

• Chromatiaceae Bavendamm 1924
  • Allochromatium Imhoff și colab. 1998
  • Chromatium Winogradsky 1888
  • Halochromatium Imhoff și colab. 1998
  • Isochromatium Imhoff și colab. 1998
  • Lamprobacter Gorlenko și colab. 1988
  • Lamprocystis Schroeter 1886
  • Marichromatium Imhoff și colab. 1998
  • Nitrosococcus Winogradsky 1892
  • Phaeochromatium Shivali și colab. 2012
  • Rhabdochromatium (Winogradsky 1888) Dilling și colab. 1996
  • Rheinheimera Brettar și colab. 2002
  • Thermochromatium Imhoff și colab. 1998
  • Thioalkalicoccus Bryantseva și colab. 2000
  • Thiobaca Rees și colab. 2002
  • Thiocapsa Winogradsky 1888
  • Thiococcus Imhoff și colab. 1998
  • Thiocystis Winogradsky 1888
  • Thiodictyon Winogradsky 1888
  • Thioflavicoccus Imhoff și Pfennig 2001
  • Thiohalocapsa Imhoff și colab. 1998
  • Thiolamprovum Guyoneaud și colab. 1998
  • Thiopedia Winogradsky 1888
  • Thiophaeococcus Anil Kumar și colab. 2008
  • Thiorhodococcus Guyoneaud și colab. 1998
  • Thiorhodovibrio Overmann și colab. 1993
  • Thiospirillum Winogradsky 1888
• Ectothiorhodospiraceae Imhoff 1984
  • Alkalilimnicola Yakimov și colab. 2001
  • Alkalispirillum Rijkenberg și colab. 2002
  • Aquisalimonas Marquez și colab. 2007
  • Arhodomonas Adkins și colab. 1993
  • Ectothiorhodosinus Gorlenko și colab. 2004
  • Ectothiorhodospira Pelsh 1936
  • Halopeptonella Menes și colab. 2016
  • Halorhodospira Imhoff și Suling 1997
  • Natronocella Sorokin și colab. 2007
  • Nitrococcus Watson și Waterbury 1971
  • Thioalbus Park și colab. 2011
  • Thioalkalivibrio Sorokin și colab. 2001
  • Thiohalospira Sorokin și colab. 2008
  • Thiorhodospira Bryantseva și colab. 1999

• Granulosicoccaceae Lee și colab. 2008
  • Granulosicoccus Lee și colab. 2008
  • Sulfuriflexus Kojima și Fuji 2016

• Halothiobacillaceae Kelly și Wood 2005
  • Halothiobacillus Kelly și Wood 2000
  • Thiofaba Mori și Suzuki 2008
  • Thiovirga Ito și colab. 2005

• Thioalkalibacteraceae Boden și colab. 2017
  • Etaj Guyparkeria 2017
  • Thioalkalibacter Banciu și colab. 2009

• Thioalkalispiraceae Mori și colab. 2011
  • Endothiovibrio Bazylinski și colab. 2017
  • Thioalkali spira Sorokin și colab. 2002
  • Thiohalophilus Sorokin și colab. 2007
  • Thioprofundum Takai și colab. 2010

• Woeseiaceae
  • Woeseia Du și colab. 2016

Sugestii și amânări

O altă familie propusă de Chromatiales este:

• Sedimenticolaceae

• Sedimenticola cu S. selenatireducens (tip), S. thiotaurini și S. endophacoides
• Candidatus thiodiazotropha cu aproximativ T. endolucinida , T. endoloripes , T. taylori , T. weberae și T. lotti
• Candidatus Endoriftia (Ca. E. persephone str.Hot96_1 + Hot96_2)

Este posibil ca mai multe dintre genurile Chromatiaceae să fie de fapt mai aproape de acest grup și să poată fi mutate aici în viitor. În silva familia Ectothiorhodospiraceae este plasată în propria ordine Ectothiorhodospirales în Gammaproteobacteria.

umfla

1. ↑ JP Euzéby: Listă de nume procariote cu poziție în nomenclatură - Chromatiales (începând cu 26 septembrie 2019)
2. ↑ silva : Sedimenticolacea (vă rugăm să accesați hyperlinkul "Sedimenticolaceae" din coloana din stânga)
3. ↑ Sedimenticola .
4. ↑ Sedimenticola . În: www.uniprot.org . Iulie.
5. ↑ Taxonomia genului Sedimenticola Narasingarao și Häggblom 2006 emend. Flood și colab. 2015 . În: NamesforLive . Iulie. doi : 10.1601 / tx.10429 .
6. ↑ ^{a b} Bertram Hausl: Diversitatea genomului și stilul de viață liber al simbionților lucinoizi chemoautotrofi , lucrare de masterat la Universitatea din Viena: Microbiologie moleculară, ecologie microbiană și imunobiologie, 2017
7. ^ Charles Thomas Parker, George M. Garrity: Taxonomia speciilor Sedimenticola selenatireducens Narasingarao și Häggblom 2006 emend. Flood și colab. 2015 . În: NamesforLive . 2008. doi : 10.1601 / tx.11019 .
8. ↑ Detalii: DSM-17993 . În: dmsz . Iulie.
9. ↑ P. Narasingarao, M. M. Häggblom: Sedimenticola selenatireducens, gen. Noiembrie, Sp. nov., o bacterie anaerobă care respiră selenatul, izolată din sedimentul estuarului. . În: Microbiologie sistematică și aplicată . 29, nr. 5, iulie 2006, pp. 382-388. doi : 10.1016 / j.syapm.2005.12.011 . PMID 16427757 .
10. ^ Charles Thomas Parker, George M. Garrity: Taxonomia speciei Sedimenticola thiotaurini Flood și colab. 2015 . În: NamesforLife . 2008. doi : 10.1601 / tx.27073 .
11. ↑ Detalii: DSM-28581 . În: dmsz . Iulie.
12. ↑ BE Flood, DS Jones, JV Bailey: Sedimenticola thiotaurini sp. nov., o bacterie oxidantă de sulf izolată din sedimentele mlaștinii sărate și descrierile emise ale genului Sedimenticola și Sedimenticola selenatireducens. . În: Jurnalul internațional de microbiologie sistematică și evolutivă . 65, nr. 8, august 2015, pp. 2522-2530. doi : 10.1099 / ijs.0.000295 . PMID 25944805 .
13. ↑ NCBI: Sedimenticola (gen)
14. ↑ LPSN: Genul " Candidatus Thiodiazotropha"
15. ↑ NCBI: Candidatus Thiodiazotropha (gen)
16. ↑ Sten König, Olivier Gros, Stefan E. Heiden, Tjorven Hinzke, Andrea Thürmer, Anja Poehlein, Susann Meyer, Magalie Vatin, Didier Mbéguié-A-Mbéguié, Jennifer Tocny, Ruby Ponnudurai, Rolf Daniel, Dörte Becher, Thomas Schweder, Stephanie Markert: Fixarea azotului într-o simbioză lucinidă chemoautotrofă , în: Nature Microbiology 2: 16193, 24 octombrie 2016, doi: 10.1038 / nmicrobiol.2016.193 , PMID 27775698
17. ↑ Comunicate de presă:
    • Laetitia Wilkins: Simbionți fără limite: locuitorii bacterieni călătoresc în lume pe EurekAlert! din 12 iulie 2021. Sursa: Max Planck Institute for Marine Microbiology
    • Fanni Aspetsberger, Laetitia Wilkins: Symbionts sans frontieres: Partenerii bacterieni călătoresc în lume , pe 12 iulie 2021; cu atașament : Habitat (Bocas del Toro, Panama)
    • Simbionți fără frontiere: partenerii bacterieni călătoresc în lume , Comunicat de presă, Institutul Max Planck pentru Microbiologie Marină, 12 iulie 2021 ( engleză )
    • Simbioză: microbii de sulf încorporați hranesc midii , pe: science.orf.at din 13 iulie 2021
    • Microbii de sulf încorporați hrănesc midiile din Elba până în Panama , pe: science.apa.at Natura din 13 iulie 2021
18. ↑ ^{a b} Jillian M. Petersen, Anna Kemper, Harald Gruber-Vodicka, Ulisse Cardini, Matthijs van der Geest, Manuel Kleiner, Silvia Bulgheresi, Marc Mußmann, Craig Herbold, Brandon KB Seah, Chakkiath Paul Antony, Dan Liu, Alexandra Belitz, Miriam Weber: Simbionții chimio-sintetici ai animalelor nevertebrate marine sunt capabili de fixare a azotului , în: Nature Microbiology, Volumul 2, Nr. 16195 (2017), 24 octombrie 2016, doi: 10.1038 / nmicrobiol.2016.195
19. ↑ Jay Osvatic, Jennifer Windisch, Benedict Yuen, Benedict, Bertram Hausl, Julia Polzin, Jillian Petersen: Chemosymbiotic lucinid scoams modifică caracteristicile fizice, chimice și biologice ale sedimentelor marine la nivel global , în: Adunarea Generală EGU, 4. - 8. Mai 2020, EGU2020-19150, doi: 10.5194 / egusphere-egu2020-19150 . Abstract
20. ↑ silva: Proteobacterii ► Gammaproteobacterii ►Ectothiorhodospirales ► Ectothiorhodospiraceae

literatură

• Michael T. Madigan, John M. Martinko, Jack Parker: Brock - Microbiologie . Ediția a XI-a. Pearson Studium, München 2006, ISBN 3-8274-0566-1
• George M. Garrity: Manualul lui Bergey de bacteriologie sistematică . Ediția a II-a. Springer, New York, 2005, Volumul 2: Proteobacteria, partea B: Gammaproteobacteria