Spustit kodon

První kodon s otevřeným čtecím rámcem (ORF) na mRNA se označuje jako start kodonu nebo iniciačního kodonu . Obecně se jedná o triplet RNA - báze kodonu , který v eukaryotech pro aminokyselinu methionin kóduje (Met) nebo modifikovaný methionin (N-formylmethionin, fMet) v bakteriích . Počátečnímu kodonu téměř vždy předchází nepřekládaná oblast ( 5'-UTR ). AUG

V genetickém kódu specifická sekvence tří nukleobází kóduje aminokyselinu. Obvykle je první základna triplet kódující sekvence mRNA , který je přeložen do aminokyseliny v peptidu je . Toto trojité kódování methioninu, a proto rodící se polypeptidový řetězec nativního proteinu začíná Met nebo fMet jako první aminokyselinou. Pro zahájení translace je speciální iniciátor tRNA používaný jako tRNA _i ^Met v archaeách a eukaryotech nebo tRNA _i ^fMet v mitochondriích a bakteriích. AUG

Po translaci lze protein upravit ( posttranslační modifikace ). Může to být například prekurzorový protein , jehož část se následně štěpí enzymaticky , takže se vytvoří aktivovaná forma proteinu, například v případě inzulínu . Polypeptidový řetězec modifikovaného proteinu potom nemusí začínat aminokyselinou methioninem. Je také možné odštěpit pouze methionin na N-konci nebo jeho formylovou skupinu .

Alternativní startovací kodony

U eukaryot je výchozím kodonem použitým téměř výlučně kodon, AUGkterý kóduje aminokyselinu methionin. Kromě toho, v některých případech, kodony ACG, CUGnebo GUGvykládat jako startovací kodon, pokud není zvláštní sekundárních struktur v kontextu sekvence povolení k mRNA.

U prokaryot, AUGalternativních zahajovacích kodony, zejména GUGa UUG, může kód první formylmethionin aminokyselin. Například Escherichia coli používá kodony AUG(77%), GUG(14%), UUG(8%) a několik dalších jako startovací kodony vazbou speciálního iniciátoru fMet-tRNA, i když v dalším průběhu prodloužení , GUGpro valin a UUGpro Zakódujte leucin. Dobře známými příklady genů, které nemají AUGstartovní kodon jsou lacl ( GUG) a LACA ( UUG) v lac operonu z E. coli .

literatura

• Rolf Knippers: Molecular Genetics. 8. přepracované vydání. Georg Thieme Verlag, Stuttgart et al. 2001, ISBN 3-13-477008-3 .

Individuální důkazy

1. ↑ C. Touriol, S. Bornes, S. Bonnal, S. Audigier, H. Prats, AC Prats, S. Vagner: Generování rozmanitosti proteinové izoformy alternativní iniciací translace v kodonech jiných než AUG. In: Biologie buňky. Svazek 95, čísla 3-4, 2003 květen-červen, str. 169-178, PMID 12867081 (Recenze).