Opakovaná DNA
Protože opakující se DNA nebo opakující se prvky DNA jsou oblasti DNA v uvedeném genomu , jejichž sekvence se skládá z opakujících se úseků. Zde by měl být uveden souhrn a přehled označení; podrobnější popis najdete pod odkazy.
Klasifikace
| Příjmení | Zkr. | Základní páry | Opakování |
|---|---|---|---|
| Satelitní DNA | 2 - 100 | 10-1000 | |
| Krátký tandemový opakování | STR | 2 - 10 | 10-1000 |
| Mikrosatelit | 2 - 4 | 10-1000 | |
| Mini satelit | 10 - 100 | 4 - 40 | |
| Dlouhé opakování terminálu | LTR | 200 - 600 | |
| Krátce rozptýlený jaderný prvek | SINUS | 100 - 500 | |
| Dlouho rozptýlený jaderný prvek | ČÁRA | 6000-7000 | |
| Tandemové opakování s proměnným počtem | VNTR |
Satelitní DNA
Satelitní DNA se často vyskytuje v oblastech centromér a telomer .
velmi krátké úseky:
Krátké tandemové opakování : Sekvence 2-10 párů bází, která se opakuje 10 až 1000krát.
Podskupina STR: mikrosatelity dlouhé 2–4 páry bází.
krátké úseky:
Mini satelit : Sekvence 10 až 100 párů bází, která se opakuje 4–40krát.
SINE a LINE
SINE a LINE se nacházejí relativně rovnoměrně rozložené mezi chromozomy.
SINE (krátké proložené jaderné prvky) mají délku 100-500 párů bází, LINE (dlouhé proložené jaderné prvky) jsou dlouhé 6000-7000 párů.
CRISPR
U většiny prokaryot existuje CRISPR -Abschnitte repetitivní DNA, která tvoří až 1% genomu. Ty tvoří mechanismus, který může prokaryotu poskytnout imunitu vůči bakteriofágům a jiné cizí DNA.
literatura
- Ussery, David W.; Wassenaar, Trudy; Borini, Stefano (22. prosince 2008). Frekvence slov, opakování a struktury související s opakováním v bakteriálních genech. Výpočet pro srovnávací mikrobiální genomiku: Bioinformatika pro mikrobiology. Computational Biology 8 (1. vyd.). Skokan. ISBN 978-1-84800-254-8 . 133 až 144.
- Jeremy M. Berg, John L. Tymoczko, Lubert Stryer : Biochemistry. 6. vydání, Spektrum Akademischer Verlag, Heidelberg 2007. ISBN 978-3-8274-1800-5 .
- Donald Voet, Judith G. Voet: Biochemistry. 3. vydání, John Wiley & Sons, New York 2004. ISBN 0-471-19350-X .
- Bruce Alberts , Alexander Johnson, Peter Walter, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts: Molecular Biology of the Cell , 5. vydání, Taylor & Francis 2007, ISBN 978-0815341062 .
