USP16 - USP16

USP16
Tilgængelige strukturer
PDB	Ortologsøgning : PDBe RCSB
Liste over PDB -id -koder
	2I50
Identifikatorer
Aliaser	USP16 , UBP-M, UBPM, ubiquitinspecifik peptidase 16
Eksterne ID'er	OMIM : 604735 MGI : 1921362 HomoloGene : 38183 GeneCards : USP16
Genplacering ( menneske )
Chr.	Kromosom 21 (menneske)
Ende	29.054.488 bp
Gen placering ( mus )
Chr.	Kromosom 16 (mus)
Ende	87.483.517 bp
RNA -udtryksmønster
	Flere referenceudtryksdata
Genontologi
Molekylær funktion	• cystein-typen peptidaseaktivitet ; • zinkion binding ; • metalionbinding ; • peptidaseaktivitet ; • hydrolaseaktivitet ; • GO: 0001105 transkription coaktivator aktivitet ; • cystein-typen endopeptidaseaktivitet ; • histon binding ; • ubiquitinbinding ; • thiol-afhængig deubiquitinase;
Cellulær komponent	• cytoplasma ; • kerne ; • nukleoplasma;
Biologisk proces	• regulering af transkription, DNA-skabelon ; • ubiquitin-afhængig proteinkatabolsk proces ; • positiv regulering af translationel forlængelse ; • regulering af transkription med RNA-polymerase II ; • monoubiquitineret histon H2A-deubiquitination ; • transkription, DNA-skabelon ; • proteolyse ; • cellulær reaktion på DNA-skader stimulus ; • celledeling ; • histon H2A K63-koblet deubiquitination ; • positiv regulering af transkription med RNA-polymerase II ; • protein-deubiquitination ; • positiv regulering af transkription, DNA-skabelon ; • protein-homotetramerisering ; • regulering af genekspression ; • histone-deubiquitination ; • regulering af cellecyklus ; • GO: 0007067 mitotisk cellecyklus ; • kromatinorganisation ; • cellecyklus ; • mitotisk nuklear division;
	Kilder: Amigo / QuickGO
Ortologer
	10600
	74112
	ENSG00000156256
	ENSMUSG00000025616
	Q9Y5T5
	Q99LG0
	NM_006447 ; NM_001001992 ; NM_001032410
	NM_024258
	NP_001001992 ; NP_001027582 ; NP_006438
	NP_077220
	Wikidata
Se/rediger menneske	Se/rediger mus

Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16 er et enzym, der hos mennesker er kodet af USP16 genet .

Dette gen koder en afubiquitinerende enzym, som phosphoryleres ved begyndelsen af mitose og dephosphoryleres derefter ved metafase / anafase overgang. Det kan deubiquitinere H2A , et af to store ubiquitinerede proteiner af kromatin , in vitro, og en mutant form af proteinet viste sig at blokere celledeling. Alternative transskriptionelle splejsningsvarianter , der koder for forskellige isoformer, er blevet karakteriseret.

Referencer

Yderligere læsning

D'Andrea A, Pellman D (1999). "Deubiquitinerende enzymer: en ny klasse af biologiske regulatorer". Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol . 33 (5): 337–52. doi : 10.1080/10409239891204251 . PMID 9827704 .
Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: en simpel metode til at erstatte capstrukturen af eukaryote mRNA'er med oligoribonucleotider". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). "Konstruktion og karakterisering af et fuldt længdeberiget og et 5'-ende-beriget cDNA-bibliotek". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Cai SY, Babbitt RW, Marchesi VT (1999). "Et mutant deubiquitinerende enzym (Ubp-M) forbinder med mitotiske kromosomer og blokerer celledeling" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 96 (6): 2828–33. Bibcode : 1999PNAS ... 96.2828C . doi : 10.1073/pnas.96.6.2828 . PMC 15854 . PMID 10077596 .
Hattori M, Fujiyama A, Taylor TD, et al. (2000). "DNA -sekvensen af humant kromosom 21" . Natur . 405 (6784): 311–9. Bibcode : 2000Natur.405..311H . doi : 10.1038/35012518 . PMID 10830953 .
Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK, et al. (2002). "Udtrykt sekvensmærkeanalyse af human nethinde til NEIBank-projektet: retbindin, et rigeligt, nyt retinal cDNA og alternativ splejsning af andre nethinden-foretrukne gentranskripter". Mol. Vis . 8 : 196–204. PMID 12107411 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering og indledende analyse af mere end 15.000 cDNA-sekvenser i fuld længde af mennesker og mus" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Komplet sekventering og karakterisering af 21.243 humane cDNA'er i fuld længde" . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
Lehner B, Sanderson CM (2004). "En proteininteraktionsramme for human mRNA -nedbrydning" . Genom Res . 14 (7): 1315–23. doi : 10.1101/gr.2122004 . PMC 442147 . PMID 15231747 .
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, et al. (2004). "Storstilet karakterisering af HeLa-celle nukleare phosphoproteiner" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "Status, kvalitet og udvidelse af NIH cDNA-projektet i fuld længde: Mammalian Gene Collection (MGC)" . Genom Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). "Mod et kort i proteomskala over det humane protein-protein-interaktionsnetværk". Natur . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
Pai MT, Tzeng SR, Kovacs JJ, et al. (2007). "Løsningsstruktur for Ubp-M BUZ-domænet, et yderst specifikt proteinmodul, der genkender den C-terminale hale af gratis ubiquitin" . J. Mol. Biol . 370 (2): 290–302. doi : 10.1016/j.jmb.2007.04.015 . PMC 2870993 . PMID 17512543 .
Joo HY, Zhai L, Yang C, et al. (2007). "Regulering af cellecyklusprogression og genekspression ved H2A -deubikitinering". Natur . 449 (7165): 1068–72. Bibcode : 2007Natur.449.1068J . doi : 10.1038/nature06256 . PMID 17914355 . S2CID 4417239 .

Denne artikel om et gen på humant kromosom 21 er en stub . Du kan hjælpe Wikipedia ved at udvide den .

Languages

In other projects

USP16 - USP16

Referencer

Yderligere læsning