Eukaryotisk initieringsfaktor 4F - Eukaryotic initiation factor 4F
Eukaryotisk initieringsfaktor 4F ( eIF4F ) er et heterotrimert proteinkompleks, der binder 5'-hætten af messenger-RNA'er (mRNA'er) for at fremme eukaryotisk translationinitiering . EIF4F-komplekset består af tre ikke-identiske underenheder: DEAD-box- RNA-helicase eIF4A , det cap-bindende protein eIF4E og det store "stillads" -protein eIF4G . Pattedyrs-eIF4F-komplekset blev først beskrevet i 1983 og har været et stort område for undersøgelse af de molekylære mekanismer til cap-afhængig translation-initiering lige siden.
Fungere
eIF4F er vigtig for rekruttering af den lille ribosomale underenhed (40S) til 5'-hætten af mRNA'er under cap-afhængig translation-initiering. Komponenter af komplekset er også involveret i cap-uafhængig oversættelsesinitiering; for eksempel spalter visse virale proteaser eIF4G for at fjerne den eIF4E-bindende region og hæmmer således cap-afhængig translation.
Struktur
Strukturer af eIF4F-komponenter er blevet løst individuelt og som delvise komplekser ved en række forskellige metoder, men der er i øjeblikket ingen komplet struktur af eIF4F.
Underenheder
Hos pattedyr kan eIF4E • G • Et trimerkompleks renses direkte fra celler, mens kun de to underenhed eIF4E • G kan oprenses fra gærceller. eIF4E binder m 7 G 5 ' -hætten og eIF4G-stilladset og forbinder mRNA-5'-terminalen til et knudepunkt for andre initieringsfaktorer og mRNA. Interaktionen mellem eIF4G • A menes at lede dannelsen af en enkeltstrenget RNA-landingsplade til 43S forinitieringskomplekset (43S PIC) via eIF4As RNA helicase- aktivitet.
EIF4F-proteinerne interagerer med et antal forskellige bindingspartnere, og der er flere genetiske isoformer af eIF4A , eIF4E og eIF4G i det humane genom. Hos pattedyr er eIF4F broforbundet til 40S ribosomal underenhed af eIF3 via eIF4G , mens spirende gær mangler denne forbindelse. Interaktioner mellem eIF4G og PABP menes at formidle cirkularisering af mRNA-partikler.
| Underenhed | MW (kDa) | Isoformer | Nøglefunktioner |
|---|---|---|---|
| eIF4A | 46 | eIF4A1 , eIF4A2 , eIF4A3 | DEAD-box RNA helicase. Binder mRNA, eIF4G, eIF4B , eIF4H og PDCD4 . Hæmmet af de små molekyler hippuristanol , rocaglamid A (RocA) og pateamin A. |
| eIF4E | 25 | eIF4E1 , eIF4E2 , eIF4E3 | Cap-bindende protein. Binder eIF4G, 4EBP1 , 4EBP2 og 4EBP3 . |
| eIF4G | 175 | eIF4G1 , eIF4G3 | "Stillads" protein. Binder mRNA, eIF4A, eIF4E og PABP . |
En omtrentlig molekylvægt for humane proteiner.
Ud over de vigtigste proteiner, der omfatter eIF4F-trimeren, interagerer eIF4F-komplekset funktionelt med proteiner, herunder eIF4B og eIF4H . Den usædvanlige isoform af eIF4G, eIF4G2 eller DAP5 ser også ud til at udføre en ikke-kanonisk oversættelsesfunktion.
Regulering
Den eIF4E underenheden af eIF4F er et vigtigt mål for mTOR signalering gennem eIF4E bindingsprotein (4E-BP) . Fosforylering af 4E-BP'er med mTOR forhindrer deres binding til eIF4E, hvilket frigør eIF4E til at binde eIF4G og deltager i initiering af oversættelse.
