LSID - LSID

Identifikátory biologických věd jsou způsob, jak pojmenovat a lokalizovat informace na webu. LSID je v zásadě jedinečný identifikátor pro některá data a protokol LSID určuje standardní způsob vyhledání dat (stejně jako standardní způsob popisu těchto dat). Jsou trochu jako DOI používané mnoha vydavateli.

LSID je reprezentován jako jednotný název prostředku (URN) v následujícím formátu:

  • urn: lsid : <Authority>: <Namespace>: <ObjectID> [: <Version>]

Lsid: namespace, však není zaregistrován u IANA (IANA), a proto se nejedná o přísně URN nebo URI.

LSID lze vyřešit v adresách URL, např. Http://zoobank.org/urn:lsid:zoobank.org:pub:CDC8D258-8F57-41DC-B560-247E17D3DC8C

Spor o používání LSID

O LSID byl velký zájem jak v bioinformatice, tak v komunitách biologické rozmanitosti , přičemž ty druhé je nadále používají jako způsob identifikace druhů v globálních katalozích. Avšak v poslední době, když se zvýšilo porozumění tomu, jak mohou HTTP URI provádět podobnou úlohu pojmenování, bylo použití LSID jako identifikátorů kritizováno jako porušení dobré praxe webové architektury opětovného použití stávajících schémat URI. Výslovné oddělení dat od metadat; specifikace metody pro zjišťování více míst pro získávání dat; a schopnost objevit více nezávislých zdrojů metadat pro jakoukoli identifikovanou věc byly klíčové součásti LSID a jeho specifikace rozlišení, které nebyly úspěšně napodobeny přístupem pouze HTTP.

World Wide Web poskytuje globálně distribuovanou komunikační rámec, který je nezbytný pro téměř všechny vědecké spolupráce, včetně bioinformatiky. Předpokládalo se však, že existuje několik omezení a nedostatků, jedním z nich byla neschopnost programově identifikovat lokálně pojmenované objekty, které mohou být široce distribuovány po síti. Tento vnímaný nedostatek by omezil naši schopnost integrovat více znalostních databází, z nichž každá poskytuje dílčí informace o sdílené doméně, jak je běžně vidět v bioinformatice. Life Science Identifier (LSID) a LSID Resolution System (LSRS) byly navrženy tak, aby poskytovaly jednoduchá a elegantní řešení tohoto problému v souladu se sémantickým webem nové generace a sémantickou mřížkou založenou na rozšíření stávajících internetových technologií. Nedávno však bylo zdůrazněno, že některé z těchto vnímaných nedostatků nejsou vlastní HTTP URI a mnoho (i když ne všechny) funkcí, které LSID poskytují, lze získat pomocí správně vytvořených HTTP URI.

Alternativní identifikátory pro organismy

Pro organismy byly navrženy alternativní identifikátory, např . Systém DOI . NamesforLife (N4L), soukromá společnost, nastavila systém pro aplikaci DOI na organismy. Například doi: 10,1601 / nm.3093 je DOI pro Escherichia coli a doi: 10,1601 / tx.3093 je odpovídající taxon.

Viz také

Poznámky

externí odkazy